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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr06G001314`

染色体: Chr06 坐标: 13633574-13634589 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr06G001314`
名称	SmilChr06G001314
描述	protein FAR1-RELATED SEQUENCE 5-like
染色体 / SeqID	Chr06 / NC_080392.1
坐标与链方向	13633574 - 13634589 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130990528`
GeneID	`130990528`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130990528`
原始查询	`LOC130990528`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	protein FAR1-RELATED SEQUENCE 5-like
产物	protein FAR1-RELATED SEQUENCE 5-like
Arabidopsis	`AT4G38180` (FRS5) FAR1-related sequence 5 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:829974] identity=35.2; qcov=0.457; evalue=9.77e-23; confidence=medium
Rice	`Os02g0550900` - identity=34.2; qcov=0.772; evalue=1.03e-32; confidence=low
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF03101 (FAR1)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130990528

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057770739.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057770739.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057770739.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057770739.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057770739.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr6:13633591`	`CG`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	2	C30,C32
`Chr6:13633591`	`CG`	`C`	1bp_deletion	CDS_variant	2	C30,C32
`Chr6:13633597`	`A`	`AG`	1bp_insertion	frameshift_variant	2	C30,C32
`Chr6:13633597`	`A`	`AG`	1bp_insertion	CDS_variant	2	C30,C32
`Chr6:13633604`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A2,C30,C32
`Chr6:13633616`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C30,C32
`Chr6:13633619`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C30,C32
`Chr6:13633645`	`CG`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	2	C30,C32
`Chr6:13633645`	`CG`	`C`	1bp_deletion	CDS_variant	2	C30,C32
`Chr6:13633652`	`T`	`TC`	1bp_insertion	frameshift_variant	2	C30,C32
`Chr6:13633652`	`T`	`TC`	1bp_insertion	CDS_variant	2	C30,C32
`Chr6:13633675`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C82

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057770739.1

311 aa

156

311

FAR1

PF03101 FAR1 100-166 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057770739.1`	Pfam	`PF03101`	FAR1	Domain	100	166	8e-10	40.0	FAR1 DNA-binding domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057914756.1
ATGAACATTGATTTGAACAATTCTTATGCCACTGAGACATTTGGAGAATCATTTAGCGGTGATGTTAACTCTCGGGGGTCTGAGGAGGGTGATCCACATGGTTACATCGATTCATTGTTTGATAGAAATGCCGATGATGACGTTGAAGGCGACGCCGATGCGGACACGGAGACAAAAATTTGTGAGTCACAAGATAATCCCAATGATGGCATTGATTCTTTTGAATCGTTGAAGAAAAGTTTTGAGATGAGGCTTGTTGT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130990528
ATGAACATTGATTTGAACAATTCTTATGCCACTGAGACATTTGGAGAATCATTTAGCGGTGATGTTAACTCTCGGGGGTCTGAGGAGGGTGATCCACATGGTTACATCGATTCATTGTTTGATAGAAATGCCGATGATGACGTTGAAGGCGACGCCGATGCGGACACGGAGACAAAAATTTGTGAGTCACAAGATAATCCCAATGATGGCATTGATTCTTTTGAATCGTTGAAGAAAAGTTTTGAGATGAGGCTTGTTGT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057770739.1
MNIDLNNSYATETFGESFSGDVNSRGSEEGDPHGYIDSLFDRNADDDVEGDADADTETKICESQDNPNDGIDSFESLKKSFEMRLVVGTEIDILHAVHKLYCDYAAVMGFSVRKGNQEYFNPTDDVRMKMYHCSCAGTADNKSSKGRIAAYKKQSYRSNCDAKLRADLLLRSARNMSRQKKRLLISMRASGIGVSKAYRFLEDEAGGRENIGFIRKDVYNELNSENRNMSKVDNGDANKLLDILTDRGMSDPSFFWKVKL...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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