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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及有 accession 序列支持的文献基因名查询；未闭环名称仅提供候选导航。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr06G001346`

染色体: Chr06 坐标: 14022020-14023541 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr06G001346`
名称	SmilChr06G001346
描述	uncharacterized SmilChr06G001346
染色体 / SeqID	Chr06 / NC_080392.1
坐标与链方向	14022020 - 14023541 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130990533`
GeneID	`130990533`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130990533`
原始查询	`LOC130990533`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os01g0650800; species=rice; confidence=medium
产物	hit=Os01g0650800; species=rice; confidence=medium
Arabidopsis	`-` -
Rice	`Os01g0650800` - identity=44.0; qcov=0.565; evalue=2.46e-77; confidence=medium
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF02992 (Transposase_21); PF13963 (Transpos_assoc)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130990533

打开注释模块

非零投票定位候选（最多五项）

Rank	定位位置	中文	五折投票比例	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057770744.1`
2	Chromosome	染色体	0.20000	`XP_057770744.1`
3	Telomere	端粒	0.20000	`XP_057770744.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr6:14022027`	`TC`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B129
`Chr6:14022027`	`TC`	`T`	1bp_deletion	CDS_variant	1	B129
`Chr6:14022029`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	18	A5,A8,B113,B138,B37,B40,B55,B59,B62,B68,B69,B70,B76,B82,C29,C53,D4,D6
`Chr6:14022034`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	5	A21,B134,B23,B30,C53
`Chr6:14022034`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A21,B134,B23,B30,C53
`Chr6:14022080`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B115,B20
`Chr6:14022215`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B129,C20,C7
`Chr6:14022223`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B114,B90
`Chr6:14022235`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C86
`Chr6:14022244`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B16
`Chr6:14022247`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A3,B16
`Chr6:14022249`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	C41,C49,C86

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057770744.1

481 aa

240

481

Transpos_assoc

Transposase_21

PF13963 Transpos_assoc 5-84 aa PF02992 Transposase_21 290-471 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057770744.1`	Pfam	`PF13963`	Transpos_assoc	Domain	5	84	2.8e-21	76.1	Transposase-associated domain
`XP_057770744.1`	Pfam	`PF02992`	Transposase_21	Family	290	471	4.9e-73	245.6	Transposase family tnp2

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057914761.1
ATGAGTGAAAATCGTGAGTGGATGTATCGGCGTTTTCTATCTGATGGAGCTTTGAATCCCGATTTTCAAAGAGGTCTTCAAGGTTTCATTGATTACGCTAACAGTAGACGTGATTTAATGGATGGTGAAAAAATTAGGTGTCCGTGTAGGAAATGCGATAATATACGTTTCCATACTAAAAATAATGTTCAGTATCACATTGCAAAGAACGGATTTGTGCGGGATTACCATATTTGGAGGTTTCATGGTGAAATTGAAAT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

lcl|NC_080392.1_cds_XP_057770744.1_32140
ATGAGTGAAAATCGTGAGTGGATGTATCGGCGTTTTCTATCTGATGGAGCTTTGAATCCCGATTTTCAAAGAGGTCTTCAAGGTTTCATTGATTACGCTAACAGTAGACGTGATTTAATGGATGGTGAAAAAATTAGGTGTCCGTGTAGGAAATGCGATAATATACGTTTCCATACTAAAAATAATGTTCAGTATCACATTGCAAAGAACGGATTTGTGCGGGATTACCATATTTGGAGGTTTCATGGTGAAATTGAAAT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057770744.1
MSENREWMYRRFLSDGALNPDFQRGLQGFIDYANSRRDLMDGEKIRCPCRKCDNIRFHTKNNVQYHIAKNGFVRDYHIWRFHGEIEMATTEYHNFEEEEANEDNYQNMVMDIAASQYNIQNIEEPPNPEAQLLYNMLKAADKELWPGCKTHSQLSLVARVMSLKAEGNMSERCFDQWLELIKEILPDNLAPTNFYDTKKLLSGMGLPAQRIDCCPNNCMLYWEDDRDLVQCKYCGESRYKNNNRDSRSSGKTLVAAKRMF...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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