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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G003167`

染色体: Chr01 坐标: 50465014-50465975 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G003167`
名称	SmilChr01G003167
描述	17.4 kDa class III heat shock protein
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	50465014 - 50465975 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130990537`
GeneID	`130990537`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130990537`
原始查询	`LOC130990537`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	17.4 kDa class III heat shock protein
产物	17.4 kDa class III heat shock protein
Arabidopsis	`AT1G54050` (AT1G54050) HSP20-like chaperones superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:841843] identity=55.4; qcov=0.921; evalue=6.43e-51; confidence=high
Rice	`Os02g0782500` (OsHSP18.0-CIII) - identity=47.6; qcov=1.11; evalue=3.02e-37; confidence=medium
GO	GO:0006457 (protein folding); GO:0009408 (response to heat); GO:0009651 (response to salt stress); GO:0042542 (response to hydrogen peroxide); GO:0043621 (GO:0043621); GO:0051082 (GO:0051082); GO:0051259 (protein complex oligomerization)
KEGG	smil04141 (Protein processing in endoplasmic reticulum - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF00011 (HSP20)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130990537

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057770750.1`
2	Cytosol	细胞质基质	1.00000	`XP_057770750.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057770750.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057770750.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057770750.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:50465382`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B11,C10
`Chr1:50465446`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D6
`Chr1:50465732`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B109,B140
`Chr1:50465741`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C48,D4

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057770750.1

151 aa

151

HSP20

PF00011 HSP20 42-149 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057770750.1`	Pfam	`PF00011`	HSP20	Domain	42	149	5.2e-23	81.8	Hsp20/alpha crystallin family

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057914767.1
ATGATTCTATTAAGGAGTGTATAATCGAACAAGAAAAAAGGGGTTTAAATTCCAACAAGTGTCGCATTTGCTAGGCATCGCCTGTCGTTTCTAGACGTTTCTTCAACATTTCTGGAATTTTCACTCTTCAGCTTTAAATCTCACTTCATTCAGCTTCTCCAAAGCAGCAAACATCATCTCAATTCGCATTCCTGCATTTCATCCAACACCACACCTACAAATCACCAACAAATTCATCGTTGATCAATCGCGGCAAAGTA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130990537
ATGAGCTCTGTTGTCGAAGCCATGGCCGACCTGCTGAATTTCCCGGAGACACTCGAGAAGATACTGCACTCCGCCTCGCGCCACGACGGCGGCGGCCGCGCCGCCGCGTCCAATTTCCCGGCCGACATTCTCGACACCCCGAAGGAATACGTGTTCTACCTAGACGTCCCGGGGCTGTCGAAATCGGATATTCAGGTGATGGTGGAGGAGGATAACACGCTGGTGATAAAGAGCAATGGGAAGAGGAAGAGGGAGGAAGG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057770750.1
MSSVVEAMADLLNFPETLEKILHSASRHDGGGRAAASNFPADILDTPKEYVFYLDVPGLSKSDIQVMVEEDNTLVIKSNGKRKREEGEEEEGCKYVRLERRPPQKLTRKFRLPENCNVSAITAKCENGVLTVVVEKLPPSPKAKSIEVAIN

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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