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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr06G001398`

染色体: Chr06 坐标: 14620616-14621188 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr06G001398`
名称	SmilChr06G001398
描述	uncharacterized SmilChr06G001398
染色体 / SeqID	Chr06 / NC_080392.1
坐标与链方向	14620616 - 14621188 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130990539`
GeneID	`130990539`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130990539`
原始查询	`LOC130990539`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	cotton fiber protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:824964]; symbol=AT3G57950; hit=AT3G57950; species=arabidopsis; confidence=medium
产物	cotton fiber protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:824964]; symbol=AT3G57950; hit=AT3G57950; species=arabidopsis; confidence=medium
Arabidopsis	`AT3G57950` (AT3G57950) cotton fiber protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:824964] identity=43.6; qcov=0.942; evalue=2.34e-31; confidence=medium
Rice	`Os09g0279200` - identity=40.4; qcov=0.521; evalue=2.69e-14; confidence=low
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF05553 (DUF761)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130990539

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell membrane	细胞膜	0.60000	`XP_057770748.1`
2	Nucleus	细胞核	0.40000	`XP_057770748.1`
3	Cytoplasm	细胞质	0.40000	`XP_057770748.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057770748.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057770748.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr6:14620815`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B67
`Chr6:14620868`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr6:14621060`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B137,B98

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057770748.1

190 aa

190

DUF761

PF05553 DUF761 154-188 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057770748.1`	Pfam	`PF05553`	DUF761	Family	154	188	6.7e-15	55.1	Cotton fibre expressed protein

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057914765.1
ATGGGTGGCCTCTCCTCCATCAAAACATCAAACCCCCTTCACATTTTCTCCATGAAACCACCATCATCACCAATATCGAAGCTCAAAACCCTCTTCCAAACCTTAATCTTCTCTCACATGTACCGTGCCGCACGTGCCCTTGTGAAGGCGAAGTCGCTCCTCCTCGAGCACGTGCGGGACATGCAGTTCCTACACTTGGCGGAGTTCAAGAGGAACAGGAACTGCAAGAGAAAGCTCTATTTCGGCTCCTTTAGGCTACA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130990539
ATGGGTGGCCTCTCCTCCATCAAAACATCAAACCCCCTTCACATTTTCTCCATGAAACCACCATCATCACCAATATCGAAGCTCAAAACCCTCTTCCAAACCTTAATCTTCTCTCACATGTACCGTGCCGCACGTGCCCTTGTGAAGGCGAAGTCGCTCCTCCTCGAGCACGTGCGGGACATGCAGTTCCTACACTTGGCGGAGTTCAAGAGGAACAGGAACTGCAAGAGAAAGCTCTATTTCGGCTCCTTTAGGCTACA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057770748.1
MGGLSSIKTSNPLHIFSMKPPSSPISKLKTLFQTLIFSHMYRAARALVKAKSLLLEHVRDMQFLHLAEFKRNRNCKRKLYFGSFRLHYNWCASHVMPLAQESYYDASWNVVVPTGTTTKSVIPDGTTSYREPEGLSRYLEWLEEEKGNQESISNEIDKLADLFIADCHEKFRLEKQESYRRFQEMMARAV

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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