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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr06G001406`

染色体: Chr06 坐标: 14761867-14762791 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr06G001406`
名称	SmilChr06G001406
描述	protein FAR1-RELATED SEQUENCE 5-like
染色体 / SeqID	Chr06 / NC_080392.1
坐标与链方向	14761867 - 14762791 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130990540`
GeneID	`130990540`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130990540`
原始查询	`LOC130990540`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	protein FAR1-RELATED SEQUENCE 5-like
产物	protein FAR1-RELATED SEQUENCE 5-like
Arabidopsis	`AT4G38180` (FRS5) FAR1-related sequence 5 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:829974] identity=30.6; qcov=1; evalue=3.34e-37; confidence=low
Rice	`Os02g0202800` (OJ1135_F06.10-2) - identity=32.2; qcov=0.986; evalue=8.09e-43; confidence=low
GO	GO:0006355 (regulation of DNA-templated transcription)
KEGG	-
Pfam	PF03101 (FAR1); PF10551 (MULE)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130990540

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057770749.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.20000	`XP_057770749.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057770749.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057770749.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057770749.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr6:14761934`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B91,C29
`Chr6:14762068`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A15,B24,B68,C85
`Chr6:14762073`	`GAA`	`G`	2bp_deletion	frameshift_variant	3	A19,A24,B30
`Chr6:14762073`	`GAA`	`G`	2bp_deletion	CDS_variant	3	A19,A24,B30
`Chr6:14762187`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B38
`Chr6:14762214`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B46,B49,B90,C79
`Chr6:14762309`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B65,B82,C42,C60
`Chr6:14762355`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B24,B68,C85
`Chr6:14762403`	`TG`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B48
`Chr6:14762403`	`TG`	`T`	1bp_deletion	CDS_variant	1	B48
`Chr6:14762449`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B24,B68,C85
`Chr6:14762559`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B24,B68

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057770749.1

280 aa

140

280

FAR1

MULE

PF03101 FAR1 17-111 aa PF10551 MULE 233-278 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057770749.1`	Pfam	`PF03101`	FAR1	Domain	17	111	4.4e-21	76.1	FAR1 DNA-binding domain
`XP_057770749.1`	Pfam	`PF10551`	MULE	Domain	233	278	6.5e-09	36.8	MULE transposase domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057914766.1
ATGAAGCCCTACGTAGGTCAAGTGTTCAAGTCTCTTAAAGATGCATTTGAGTTTTATAAAAATTACGGAAGCTCGTCTGGATTCGATGTTCGTAAAGGCGCTCTTAAGAGAGGGAAATATGGGCAGATTCTATATCAATATTTTTTCTGCATCAGAGAAGGCATTAATCCTGCTAAGCATGATCAGTCATCCGAAACACAGCCGAAGAAAAAAAAGAGACGCCGAAAGCCATCCACTAGGAACGGCTGCAAAGCACGTGT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130990540
ATGAAGCCCTACGTAGGTCAAGTGTTCAAGTCTCTTAAAGATGCATTTGAGTTTTATAAAAATTACGGAAGCTCGTCTGGATTCGATGTTCGTAAAGGCGCTCTTAAGAGAGGGAAATATGGGCAGATTCTATATCAATATTTTTTCTGCATCAGAGAAGGCATTAATCCTGCTAAGCATGATCAGTCATCCGAAACACAGCCGAAGAAAAAAAAGAGACGCCGAAAGCCATCCACTAGGAACGGCTGCAAAGCACGTGT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057770749.1
MKPYVGQVFKSLKDAFEFYKNYGSSSGFDVRKGALKRGKYGQILYQYFFCIREGINPAKHDQSSETQPKKKKRRRKPSTRNGCKARVTVRITNEGEYIVSNIAEAHNHELVTPECRHLMKCNRNLDPSHHMIMLKCAKANIGPMRAFRIFKELVCSYEDVGCTSDDFRNLSYEMNCYPDGSDAQLLLDRFITKRDLDDRFKCEYLLDECQKVKSIFWSDATGVENFRTFGDAVSFDATYSTNRYNMIFAPFTGKDNHGGC...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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