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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G003168`

染色体: Chr01 坐标: 50470002-50476929 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G003168`
名称	SmilChr01G003168
描述	protein SLOW WALKER 2
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	50470002 - 50476929 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130990544`
GeneID	`130990544`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130990544`
原始查询	`LOC130990544`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	protein SLOW WALKER 2
产物	protein SLOW WALKER 2
Arabidopsis	`AT1G72440` (EDA25) CCAAT-binding factor [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:843576] identity=57.7; qcov=0.907; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os09g0116400` (BIP111) - identity=49.8; qcov=1.01; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0005634 (nucleus)
KEGG	-
Pfam	PF03914 (CBF)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130990544

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057770756.1`
2	Nucleolus	核仁	1.00000	`XP_057770756.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057770756.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057770756.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057770756.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:50470420`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B13,C14,C74
`Chr1:50470494`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B81
`Chr1:50470533`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B11,C10
`Chr1:50470542`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A7,B14,C26
`Chr1:50470560`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A19,B9
`Chr1:50470637`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A18,B87
`Chr1:50470641`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B109,B140
`Chr1:50470646`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B69
`Chr1:50470812`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B43,C48,D4
`Chr1:50470823`	`TC`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B30
`Chr1:50470823`	`TC`	`T`	1bp_deletion	CDS_variant	1	B30
`Chr1:50470825`	`TTC`	`T`	2bp_deletion	frameshift_variant	1	B30

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057770756.1

1056 aa

528

1056

CBF

PF03914 CBF 529-773 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057770756.1`	Pfam	`PF03914`	CBF	Repeat	529	773	5.8e-43	147.5	CBF/Mak21 family

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057914773.1
CGTTTGCGAGGTCCAAAACCCTTAAAACCCTCCACTGCAGCTGCCAGCTGCTCATCACTCCGAAAATGGTCGCCGTGAAAAAAACCAAACCCCCAATGGACGCCGCCGTCGACCTCAAATCCGACGTCGCCGCCTTCGCCTCTTCCCTCGGCTTCTCGTCCTCCGCCCCCTCCTCCGGCTTCAACGACGCCGATTTCCGCAAAACCGGCTCCTTCAAACCCGCCTCCCAATCCCCAACCCAAAAACCACCACCCGCAGCC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130990544
ATGGTCGCCGTGAAAAAAACCAAACCCCCAATGGACGCCGCCGTCGACCTCAAATCCGACGTCGCCGCCTTCGCCTCTTCCCTCGGCTTCTCGTCCTCCGCCCCCTCCTCCGGCTTCAACGACGCCGATTTCCGCAAAACCGGCTCCTTCAAACCCGCCTCCCAATCCCCAACCCAAAAACCACCACCCGCAGCCAAAAACCCTAAATCAAACCCCAAGCAATATCCTAAACCAGCTCAAAACCAGAAGGGCGATTTCAA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057770756.1
MVAVKKTKPPMDAAVDLKSDVAAFASSLGFSSSAPSSGFNDADFRKTGSFKPASQSPTQKPPPAAKNPKSNPKQYPKPAQNQKGDFKSGNSQEKRVDGKFGNHKPSTKQYPKPAQNQKRDFRSSNLPEENDYSKFKNLPKLPLVKSSSSGVWHSDAAELEEKLIGNDKKIEFKDAEEWNGLVEKKKELGERLLAQYAQEYLSSRGQHGDIKMLFATQRSGTAADKVSALSVLIGDNAVANLRAIDTLLGMVTSKVGKRHA...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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