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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr06G001476`

染色体: Chr06 坐标: 15658947-15660375 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr06G001476`
名称	SmilChr06G001476
描述	uncharacterized SmilChr06G001476
染色体 / SeqID	Chr06 / NC_080392.1
坐标与链方向	15658947 - 15660375 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130990562`
GeneID	`130990562`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130990562`
原始查询	`LOC130990562`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os03g0643050; species=rice; confidence=medium
产物	hit=Os03g0643050; species=rice; confidence=medium
Arabidopsis	`AT5G41980` (AT5G41980) nuclease [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:834203] identity=34.1; qcov=0.847; evalue=7.96e-43; confidence=low
Rice	`Os03g0643050` - identity=43.6; qcov=0.718; evalue=1.17e-60; confidence=medium
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF01609 (DDE_Tnp_1); PF04827 (Plant_tran); PF13359 (DDE_Tnp_4)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130990562

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057770768.1`
2	Telomere	端粒	0.40000	`XP_057770768.1`
3	Cytoplasm	细胞质	0.40000	`XP_057770768.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057770768.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057770768.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr6:15658987`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B119,C87,D2
`Chr6:15658999`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B46,B52
`Chr6:15659010`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A22,B48,B58,B89
`Chr6:15659031`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A24
`Chr6:15659038`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A15,B9,C38
`Chr6:15659105`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	43	A10,A16,A21,A25,A8,B101,B11,B112,B113,B114,B115,B120,B16,B17,B20,B27,B28,B29,B3,B31,B4,B44,B62,B65,B67,B69,B85,B89,C11,C31,C33,C42,C44,C46,C52,C58,C67,C69,C7,C73,C80,C83,C84
`Chr6:15659120`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C43
`Chr6:15659123`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A6,C47,C7
`Chr6:15659154`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr6:15659209`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B129,B45
`Chr6:15659221`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	1	C35
`Chr6:15659221`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C35

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057770768.1

326 aa

163

326

Plant_tran

DDE_Tnp_1

DDE_Tnp_4

PF04827 Plant_tran 92-264 aa PF01609 DDE_Tnp_1 95-261 aa PF13359 DDE_Tnp_4 101-262 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057770768.1`	Pfam	`PF04827`	Plant_tran	Family	92	264	4.9e-06	27.0	Plant transposon protein
`XP_057770768.1`	Pfam	`PF01609`	DDE_Tnp_1	Domain	95	261	9.8e-10	39.2	Transposase DDE domain
`XP_057770768.1`	Pfam	`PF13359`	DDE_Tnp_4	Domain	101	262	3.3e-23	82.8	DDE superfamily endonuclease

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057914785.1
ATGTCTTCTCCATGCCGGGTGAATGCATATGTGTATGCTATGTTAGAGGAAATTTTGCTTCAGCTATTATTGCAACTTCTAGTTGTGGTTGATCACATGATCAAGATTAGGTCCCGAAAGAGGAAACAGAATTCATTGGCTGAGCCATATAGCATGATAGCTCGTATACCAGAACAAGTTAGGCATATGAATAGGCTGGCCATTTTGTCACTGCATTTGATGTTGTTTGTCAAACCGAAACCTGTTGAAGAAGACTGCGT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130990562
ATGTCTTCTCCATGCCGGGTGAATGCATATGTGTATGCTATGTTAGAGGAAATTTTGCTTCAGCTATTATTGCAACTTCTAGTTGTGGTTGATCACATGATCAAGATTAGGTCCCGAAAGAGGAAACAGAATTCATTGGCTGAGCCATATAGCATGATAGCTCGTATACCAGAACAAGTTAGGCATATGAATAGGCTGGCCATTTTGTCACTGCATTTGATGTTGTTTGTCAAACCGAAACCTGTTGAAGAAGACTGCGT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057770768.1
MSSPCRVNAYVYAMLEEILLQLLLQLLVVVDHMIKIRSRKRKQNSLAEPYSMIARIPEQVRHMNRLAILSLHLMLFVKPKPVEEDCVDSRWRWFQGCLGALDGTYIDVMVPNKDKPRYRTRKGHISTNTLAVCDRYLKFVYVLPGWEGSTADSRVLRDALIRPHGLRVPKGNYYLCDNGYANCEGFLAPYKGVRYHLKEWGPMCARPQNARELFNLRHAKARNIIERAFGIMKMRWGILRSTSYYPVKTQNRLIMACFII...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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