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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr06G001491`

染色体: Chr06 坐标: 15938082-15938747 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr06G001491`
名称	SmilChr06G001491
描述	uncharacterized SmilChr06G001491
染色体 / SeqID	Chr06 / NC_080392.1
坐标与链方向	15938082 - 15938747 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130990568`
GeneID	`130990568`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130990568`
原始查询	`LOC130990568`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os01g0930300; species=rice; confidence=weak
产物	hit=Os01g0930300; species=rice; confidence=weak
Arabidopsis	`AT3G09510` (AT3G09510) Ribonuclease H-like superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:820108] identity=23.4; qcov=1.06; evalue=7.4e-10; confidence=weak
Rice	`Os01g0930300` - identity=24.8; qcov=1.09; evalue=2.78e-11; confidence=weak
GO	GO:0003676 (nucleic acid binding); GO:0004523 (RNA-DNA hybrid ribonuclease activity)
KEGG	-
Pfam	PF13456 (RVT_3); PF13966 (zf-RVT)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130990568

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	0.60000	`XP_057770772.1`
2	Cytosol	细胞质基质	0.60000	`XP_057770772.1`
3	Endoplasmic reticulum	内质网	0.20000	`XP_057770772.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057770772.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057770772.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr6:15938086`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B108,B22,B36,C79
`Chr6:15938103`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A4,B46,B52,D11
`Chr6:15938121`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	5	A4,B1,B46,B52,C61
`Chr6:15938121`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A4,B1,B46,B52,C61
`Chr6:15938132`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B104,B47,C27,D4
`Chr6:15938139`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A24,C13,C86
`Chr6:15938185`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B11,C22
`Chr6:15938201`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B50,B80
`Chr6:15938220`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B107,C2,C32,C68
`Chr6:15938242`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B140,B7,C24
`Chr6:15938295`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	3	B21,B44,B75
`Chr6:15938295`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B21,B44,B75

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057770772.1

221 aa

110

221

zf-RVT

RVT_3

PF13966 zf-RVT 4-46 aa PF13456 RVT_3 157-216 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057770772.1`	Pfam	`PF13966`	zf-RVT	Domain	4	46	1e-07	33.2	zinc-binding in reverse transcriptase
`XP_057770772.1`	Pfam	`PF13456`	RVT_3	Domain	157	216	1.3e-05	25.8	Reverse transcriptase-like

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057914789.1
ATGGCGTACACTCTACCCACAGCACAAGGGCTAAGGAGCCGATCCATTGAGGTGGACCCGATTTGCCGAAGATGTGGTAAGGATGTGGAAACTCTTGAGCATGCGTTGAGGGACTGCTCGTGGGCAAGATTTTTATGGGAAGTCTCGCCTCTCTGCCTAACCCATTTCGACGGTGATGAGTTGTGGGATATTCCTTCTTGGTTTGAAAAGATTCAGCGCATACCACAGAAGGAACACCATAGTACTTTTGCAAATATTGC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130990568
ATGGCGTACACTCTACCCACAGCACAAGGGCTAAGGAGCCGATCCATTGAGGTGGACCCGATTTGCCGAAGATGTGGTAAGGATGTGGAAACTCTTGAGCATGCGTTGAGGGACTGCTCGTGGGCAAGATTTTTATGGGAAGTCTCGCCTCTCTGCCTAACCCATTTCGACGGTGATGAGTTGTGGGATATTCCTTCTTGGTTTGAAAAGATTCAGCGCATACCACAGAAGGAACACCATAGTACTTTTGCAAATATTGC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057770772.1
MAYTLPTAQGLRSRSIEVDPICRRCGKDVETLEHALRDCSWARFLWEVSPLCLTHFDGDELWDIPSWFEKIQRIPQKEHHSTFANIAWVIWFARNMLTFQEREFSHVDCLLMAQRATCTKRVCESPSRSPPTKRECTRRDQVKVWSDVAVELNVGLGFGVIMKDGEGKFLGCRHGFRYGMFTEVEAEAVGVMEAFNFYREKGVSDAIVEMDCLPLLETGET

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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