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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr06G001507`

染色体: Chr06 坐标: 16102819-16103547 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr06G001507`
名称	SmilChr06G001507
描述	uncharacterized protein At4g02000-like
染色体 / SeqID	Chr06 / NC_080392.1
坐标与链方向	16102819 - 16103547 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130990571`
GeneID	`130990571`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130990571`
原始查询	`LOC130990571`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	Ta11-like non-LTR retrotransposon [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:818757]; symbol=AT2G41590; hit=AT2G41590; species=arabidopsis; confidence=low
产物	Ta11-like non-LTR retrotransposon [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:818757]; symbol=AT2G41590; hit=AT2G41590; species=arabidopsis; confidence=low
Arabidopsis	`AT2G41590` (AT2G41590) Ta11-like non-LTR retrotransposon [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:818757] identity=25; qcov=0.975; evalue=2.49e-15; confidence=low
Rice	`Os12g0156200` - identity=28.9; qcov=0.831; evalue=3.71e-13; confidence=low
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF14111 (DUF4283); PF14392 (zf-CCHC_4)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130990571

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	0.80000	`XP_057770775.1`
2	Cytosol	细胞质基质	0.80000	`XP_057770775.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057770775.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057770775.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057770775.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr6:16102891`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B62,B7
`Chr6:16102931`	`AC`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	D11
`Chr6:16102931`	`AC`	`A`	1bp_deletion	CDS_variant	1	D11
`Chr6:16102933`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	1	D11
`Chr6:16102933`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr6:16102935`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B12,B130,C27,C59
`Chr6:16102937`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A14,B120
`Chr6:16102938`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B12,B130,C27,C59
`Chr6:16102979`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	23	A13,A16,A21,A5,A8,B110,B19,B25,B50,B60,B62,B88,B98,C12,C31,C35,C4,C57,C6,C87,D11,D7,D9
`Chr6:16102981`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	20	A15,A24,A4,B112,B125,B139,B31,B62,B82,B9,C11,C13,C14,C21,C38,C69,C79,C86,C87,D10
`Chr6:16102984`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B62,B7
`Chr6:16102985`	`CG`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	2	B124,B42

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057770775.1

242 aa

121

242

DUF4283

zf-CCHC_4

PF14111 DUF4283 28-103 aa PF14392 zf-CCHC_4 167-211 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057770775.1`	Pfam	`PF14111`	DUF4283	Domain	28	103	1.2e-17	64.1	Domain of unknown function (DUF4283)
`XP_057770775.1`	Pfam	`PF14392`	zf-CCHC_4	Domain	167	211	3.1e-11	43.4	Zinc knuckle

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057914792.1
ATGGCTGCTCTTAACCTATCCAATGAAGATGATGAATTGATCCTCGATGATGATATTACAGGGGAGTCGTCTGTCTCCGTCGATCTTTGTTTGGTTGGAAGATTCCTCACTGACCAGCCGATTAATTTCAACCTAATGCGCAGCCGTTTGGCTAGCATTTGGCGACCGGGAAAGGGAGTTTTCATGAAGGACATTGGTCAAGGAAGGTTTATATTCCAATTTTTTCATGAGCTTGATCTACTGTGGGTTTATGATGGAGG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130990571
ATGGCTGCTCTTAACCTATCCAATGAAGATGATGAATTGATCCTCGATGATGATATTACAGGGGAGTCGTCTGTCTCCGTCGATCTTTGTTTGGTTGGAAGATTCCTCACTGACCAGCCGATTAATTTCAACCTAATGCGCAGCCGTTTGGCTAGCATTTGGCGACCGGGAAAGGGAGTTTTCATGAAGGACATTGGTCAAGGAAGGTTTATATTCCAATTTTTTCATGAGCTTGATCTACTGTGGGTTTATGATGGAGG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057770775.1
MAALNLSNEDDELILDDDITGESSVSVDLCLVGRFLTDQPINFNLMRSRLASIWRPGKGVFMKDIGQGRFIFQFFHELDLLWVYDGGSWSFGNFPLILHRLKKGEFSLAVPLDSLPFWVQIHDLPAGYLTEGVGKLLGNFIGDFLEYDSTNSSSVWRQYMRIRVGIRVLLKRFKKIKHKDGSSFIVNFKYERLNVFCFLCERLGNSESLCELIFSAMKDTKREWGVGLKAADRRSLNLAGDK

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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