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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr06G001545`

染色体: Chr06 坐标: 16755418-16759791 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr06G001545`
名称	SmilChr06G001545
描述	uncharacterized SmilChr06G001545
染色体 / SeqID	Chr06 / NC_080392.1
坐标与链方向	16755418 - 16759791 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130990578`
GeneID	`130990578`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130990578`
原始查询	`LOC130990578`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	NAD(P)-binding Rossmann-fold superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:823760]; symbol=AT3G46170; hit=AT3G46170; species=arabidopsis; confidence=high
产物	NAD(P)-binding Rossmann-fold superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:823760]; symbol=AT3G46170; hit=AT3G46170; species=arabidopsis; confidence=high
Arabidopsis	`AT3G46170` (AT3G46170) NAD(P)-binding Rossmann-fold superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:823760] identity=48; qcov=1.04; evalue=2.12e-72; confidence=high
Rice	`Os08g0510400` - identity=47.2; qcov=1.05; evalue=1.17e-59; confidence=high
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF00106 (adh_short); PF08659 (KR); PF13561 (adh_short_C2)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130990578

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	0.60000	`XP_057770782.1`
2	Cytosol	细胞质基质	0.40000	`XP_057770782.1`
3	Peroxisome	过氧化物酶体	0.40000	`XP_057770782.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057770782.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057770782.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr6:16755433`	`C`	`CTT`	2bp_insertion	frameshift_variant	26	A2,A7,B10,B12,B135,B2,B27,B38,B40,B44,B55,B64,B66,B76,B90,B92,C1,C18,C2,C27,C37,C53,C55,C61,C85,D4
`Chr6:16755474`	`CGT`	`C`	2bp_deletion	frameshift_variant	57	A10,A11,A21,A22,A24,A25,A5,B105,B106,B108,B109,B115,B120,B124,B20,B22,B24,B36,B49,B5,B55,B68,B69,B76,B79,B81,B86,B91,B93,B98,B99,C17,C26,C33,C34,C36,C43,C45,C46,C48,C5,C51,C53,C57,C60,C61,C70,C77,C78,C79,C8,C81,C86,D11,D2,D4,D5
`Chr6:16755481`	`AG`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	57	A10,A11,A21,A22,A24,A25,A5,B105,B106,B108,B109,B115,B120,B124,B20,B22,B24,B36,B49,B5,B55,B68,B69,B76,B79,B81,B86,B91,B93,B98,B99,C17,C26,C33,C34,C36,C43,C45,C46,C48,C5,C51,C53,C57,C60,C61,C70,C77,C78,C79,C8,C81,C86,D11,D2,D4,D5
`Chr6:16755492`	`GA`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	3	B17,B34,C85
`Chr6:16755492`	`GA`	`G`	1bp_deletion	CDS_variant	3	B17,B34,C85
`Chr6:16755556`	`C`	`CAA`	2bp_insertion	frameshift_variant	146	A10,A13,A14,A15,A16,A18,A19,A20,A22,A3,A4,A5,A6,A8,A9,B103,B105,B107,B108,B11,B110,B112,B118,B12,B120,B121,B123,B125,B126,B13,B130,B131,B134,B135,B136,B137,B138,B139,B14,B140,B16,B17,B19,B23,B25,B26,B27,B28,B29,B31,B32,B33,B34,B35,B37,B41,B42,B43,B45,B47,B50,B51,B52,B53,B57,B58,B59,B60,B62,B63,B64,B65,B67,B68,B72,B73,B75,B77,B78,B80,B82,B83,B84,B86,B88,B89,B9,B95,B96,B98,C1,C10,C11,C12,C13,C14,C16,C17,C18,C19,C2,C21,C22,C24,C25,C29,C3,C31,C32,C35,C38,C4,C40,C41,C47,C48,C5,C50,C51,C57,C59,C6,C60,C63,C64,C66,C68,C69,C7,C72,C73,C74,C79,C80,C83,C85,C87,D10,D11,D2,D3,D5,D6,D7,D8,D9
`Chr6:16755577`	`TA`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	C42
`Chr6:16755577`	`TA`	`T`	1bp_deletion	CDS_variant	1	C42
`Chr6:16755613`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A20,B12,B51,B64,C6
`Chr6:16755635`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B107
`Chr6:16755753`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B47
`Chr6:16755783`	`GCC`	`G`	2bp_deletion	frameshift_variant	1	B10

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057770782.1

259 aa

130

259

adh_short

adh_short_C2

PF00106 adh_short 15-212 aa PF08659 KR 17-169 aa PF13561 adh_short_C2 21-210 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057770782.1`	Pfam	`PF00106`	adh_short	Domain	15	212	1.8e-37	129.4	short chain dehydrogenase
`XP_057770782.1`	Pfam	`PF08659`	KR	Family	17	169	9.5e-06	26.4	KR domain
`XP_057770782.1`	Pfam	`PF13561`	adh_short_C2	Domain	21	210	8.8e-24	85.1	Enoyl-(Acyl carrier protein) reductase

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057914799.1
ATGACGAACAAGAAGGTGGCATTGGAGACTCACCTCCCCGACAAAATTGTCTTGGTCACTGGGGCGTCCTCCGGCCTTGGCCTCGAGTTCTGCCTCGATCTCGCCGCAGCCGGCTGCCGGATTGTCGCGGCTGCACGTCGGACCGATCGGCTCGAGTCCCTATGCGATCAAATCAACGGGCAAATTGATGGAGTGAGCAATGGTGGCTCGTGTCGAGCCAAATCTGTGGTGCTCGACGTCACGGCGGACGGCCCAACTAT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130990578
ATGACGAACAAGAAGGTGGCATTGGAGACTCACCTCCCCGACAAAATTGTCTTGGTCACTGGGGCGTCCTCCGGCCTTGGCCTCGAGTTCTGCCTCGATCTCGCCGCAGCCGGCTGCCGGATTGTCGCGGCTGCACGTCGGACCGATCGGCTCGAGTCCCTATGCGATCAAATCAACGGGCAAATTGATGGAGTGAGCAATGGTGGCTCGTGTCGAGCCAAATCTGTGGTGCTCGACGTCACGGCGGACGGCCCAACTAT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057770782.1
MTNKKVALETHLPDKIVLVTGASSGLGLEFCLDLAAAGCRIVAAARRTDRLESLCDQINGQIDGVSNGGSCRAKSVVLDVTADGPTIEAAVEKAWYAFGHVDVLINNAGVRVNDGPIGPKRPALELSNEEWHNVVKTNLTGSWLVSKYVGARXARRGGSIINISSNAGLSRVYQGLLFWQIMALELGAYNIRMNSIAPGLFKSEMTINLMKKKWVREGEDLERGIQHSSHLSFVIHDSSAYVDAGYTLPAYESKKIQDQ

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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