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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr06G001553`

染色体: Chr06 坐标: 16914383-16915956 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr06G001553`
名称	SmilChr06G001553
描述	protein ALP1-like
染色体 / SeqID	Chr06 / NC_080392.1
坐标与链方向	16914383 - 16915956 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130990580`
GeneID	`130990580`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130990580`
原始查询	`LOC130990580`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	protein ALP1-like
产物	protein ALP1-like
Arabidopsis	`AT2G13770` (AT2G13770) nuclease [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:815861] identity=53.6; qcov=0.261; evalue=2.67e-33; confidence=weak
Rice	`Os06g0597250` - identity=50; qcov=0.984; evalue=1.52e-136; confidence=high
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF04827 (Plant_tran); PF13359 (DDE_Tnp_4); PF28509 (DUF8418)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130990580

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057770783.1`
2	Chromosome	染色体	0.40000	`XP_057770783.1`
3	Telomere	端粒	0.20000	`XP_057770783.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057770783.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057770783.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr6:16914396`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C2
`Chr6:16914403`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B118,B71
`Chr6:16914404`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B49,B67,B69,C66,C83
`Chr6:16914412`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B77
`Chr6:16914416`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	4	A1,B129,C10,C36
`Chr6:16914416`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A1,B129,C10,C36
`Chr6:16914423`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C62
`Chr6:16914425`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B70,B77
`Chr6:16914445`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A11,B104,C36,C71
`Chr6:16914446`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	1	C10
`Chr6:16914446`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C10
`Chr6:16914457`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B91,C10

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057770783.1

429 aa

214

429

DUF8418

Plant_tran

DDE_Tnp_4

PF28509 DUF8418 61-96 aa PF04827 Plant_tran 165-368 aa PF13359 DDE_Tnp_4 196-359 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057770783.1`	Pfam	`PF28509`	DUF8418	Domain	61	96	5.1e-18	65.3	Domain of unknown function (DUF8418)
`XP_057770783.1`	Pfam	`PF04827`	Plant_tran	Family	165	368	3.8e-89	298.4	Plant transposon protein
`XP_057770783.1`	Pfam	`PF13359`	DDE_Tnp_4	Domain	196	359	4.5e-09	36.8	DDE superfamily endonuclease

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057914800.1
ATGTCTTCCTCCTCATCAAGCCACGAGGACGAGCGACGTGCTGAAGAATTTTCCAATCTTGTGCAAGAATATAACCAAATTGTTCAAGATATTGGTGATCCAGATGAGCAACCTCGTCGTTGGCGACGAAGCGTGGCAAAGAAGGCCTACATTCGTCGGGACCGTGAAGCCAGCGCTCTACATTTGCACGCGGATTACTTTGATGAAAATCCGGTCTACCCCGACAACATTTTCCGCCTCCGATTTCGGATGCGGCGTGC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130990580
ATGTCTTCCTCCTCATCAAGCCACGAGGACGAGCGACGTGCTGAAGAATTTTCCAATCTTGTGCAAGAATATAACCAAATTGTTCAAGATATTGGTGATCCAGATGAGCAACCTCGTCGTTGGCGACGAAGCGTGGCAAAGAAGGCCTACATTCGTCGGGACCGTGAAGCCAGCGCTCTACATTTGCACGCGGATTACTTTGATGAAAATCCGGTCTACCCCGACAACATTTTCCGCCTCCGATTTCGGATGCGGCGTGC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057770783.1
MSSSSSSHEDERRAEEFSNLVQEYNQIVQDIGDPDEQPRRWRRSVAKKAYIRRDREASALHLHADYFDENPVYPDNIFRLRFRMRRALFLRIVTAVASDPYFQQRTDALGRPGFTPLQKYTIAVRMLANGGAADQYDEYLRIAESTSLECLRRFSRAIIQLFGAEYLRRPTSADCQRLLAMHEAKHGFPGMLGSLDCMHWSLKNCLTAWQSAYTRGDQGEPTIILEAVASQDLWIWHAFFGTPGSNNDINVLNNSTLFND...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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