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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr06G001600`

染色体: Chr06 坐标: 17783319-17783981 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr06G001600`
名称	SmilChr06G001600
描述	uncharacterized SmilChr06G001600
染色体 / SeqID	Chr06 / NC_080392.1
坐标与链方向	17783319 - 17783981 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130990593`
GeneID	`130990593`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130990593`
原始查询	`LOC130990593`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os06g0704400; species=rice; confidence=low
产物	hit=Os06g0704400; species=rice; confidence=low
Arabidopsis	`AT5G15685` (AT5G15685) mutator transposase MUDRA protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:28721163] identity=28.2; qcov=0.982; evalue=4.6e-23; confidence=low
Rice	`Os06g0704400` - identity=31.8; qcov=0.986; evalue=4.35e-29; confidence=low
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF03108 (DBD_Tnp_Mut)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130990593

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057770798.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057770798.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057770798.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057770798.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057770798.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr6:17783335`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B90,B92
`Chr6:17783347`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B23,C64,C66
`Chr6:17783349`	`GA`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	3	B130,B136,C33
`Chr6:17783349`	`GA`	`G`	1bp_deletion	CDS_variant	3	B130,B136,C33
`Chr6:17783355`	`T`	`TTA`	2bp_insertion	stop_gained,frameshift_variant	51	A1,A22,B111,B112,B113,B128,B14,B18,B21,B22,B23,B26,B42,B48,B58,B6,B67,B69,B72,B86,B9,B96,B98,C1,C16,C22,C25,C28,C32,C34,C37,C38,C39,C4,C40,C43,C49,C52,C56,C59,C60,C61,C66,C67,C69,C71,C76,C85,D1,D3,D7
`Chr6:17783437`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B56,B96,C13,C78,C83
`Chr6:17783467`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B105,B109,B114,C30,C49
`Chr6:17783510`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B27,B79
`Chr6:17783514`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B27
`Chr6:17783628`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	10	B122,B136,B14,B24,B35,B4,B46,B53,C23,C8
`Chr6:17783637`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B35
`Chr6:17783649`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C74

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057770798.1

220 aa

110

220

DBD_Tnp_Mut

PF03108 DBD_Tnp_Mut 2-57 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057770798.1`	Pfam	`PF03108`	DBD_Tnp_Mut	Family	2	57	4.8e-06	26.9	MuDR family transposase

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057914815.1
ATGACCTTTGCCGAGGCAAAGGATGCTAGAGAGGCTTTAGCCAGATATTATGTGAGATTTGGATACAAGCTTAAGTTTATGAAGAATGAACCTAAGCGAGTTAGAGTTGTATGCATTAGTGAAAAGGACTGTCCCTTTTTATTACTTGCATCAAAGGATGGGGATAAAGAGGGTTTGATCATTAAAACATTGGTGGCAGAGCACAGTTGTTGTAGGCAAAGAGAAGTGCCTAGTGCTTCTCAATCTTATTTGGCAAATTA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130990593
ATGACCTTTGCCGAGGCAAAGGATGCTAGAGAGGCTTTAGCCAGATATTATGTGAGATTTGGATACAAGCTTAAGTTTATGAAGAATGAACCTAAGCGAGTTAGAGTTGTATGCATTAGTGAAAAGGACTGTCCCTTTTTATTACTTGCATCAAAGGATGGGGATAAAGAGGGTTTGATCATTAAAACATTGGTGGCAGAGCACAGTTGTTGTAGGCAAAGAGAAGTGCCTAGTGCTTCTCAATCTTATTTGGCAAATTA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057770798.1
MTFAEAKDAREALARYYVRFGYKLKFMKNEPKRVRVVCISEKDCPFLLLASKDGDKEGLIIKTLVAEHSCCRQREVPSASQSYLANYFKDVVYRNPRFTAKDMQGHVKEHLKLHVSMGKCKRAKKAIITKLQGSYKQEFNMLMGYIEKVKETNSGSKMELQLSKDELANGRRVFKRLFVMFDACRQNWKKGCRPLISLDGCHIKGVTFGCLLTAVGQFYM

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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