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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr06G001632`

染色体: Chr06 坐标: 18293147-18293485 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr06G001632`
名称	SmilChr06G001632
描述	uncharacterized SmilChr06G001632
染色体 / SeqID	Chr06 / NC_080392.1
坐标与链方向	18293147 - 18293485 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130990600`
GeneID	`130990600`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130990600`
原始查询	`LOC130990600`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	confidence=no_hit
产物	confidence=no_hit
Arabidopsis	`-` -
Rice	`-` -
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF14223 (Retrotran_gag_2)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130990600

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	0.40000	`XP_057770807.1`
2	Secreted	分泌到胞外	0.40000	`XP_057770807.1`
3	Cytosol	细胞质基质	0.20000	`XP_057770807.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057770807.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057770807.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr6:18293184`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B110
`Chr6:18293231`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A10,B35,B80
`Chr6:18293256`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C34,C75
`Chr6:18293268`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A18
`Chr6:18293281`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B35,B80
`Chr6:18293282`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	141	A1,A11,A14,A16,A18,A19,A2,A21,A22,A23,A24,A25,A4,A6,A9,B10,B100,B102,B103,B104,B105,B106,B108,B111,B112,B113,B114,B117,B118,B119,B120,B122,B125,B126,B129,B131,B132,B134,B135,B136,B137,B139,B140,B15,B16,B17,B19,B2,B20,B22,B23,B25,B26,B28,B3,B31,B32,B36,B38,B39,B4,B40,B46,B47,B50,B52,B53,B56,B58,B61,B63,B64,B65,B66,B70,B71,B72,B75,B8,B81,B83,B94,B95,B96,B97,B98,C1,C13,C16,C19,C20,C21,C22,C23,C25,C27,C28,C3,C31,C33,C35,C39,C4,C40,C41,C42,C46,C47,C48,C49,C52,C56,C57,C58,C59,C6,C60,C62,C64,C65,C66,C7,C70,C71,C73,C76,C77,C79,C80,C82,C83,C84,C87,D1,D10,D11,D3,D4,D5,D6,D8
`Chr6:18293287`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A20,B57,B6,C36
`Chr6:18293327`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B125,B6,C26,C87
`Chr6:18293333`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B34,C85
`Chr6:18293342`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D7
`Chr6:18293344`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B28
`Chr6:18293356`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A19

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057770807.1

112 aa

112

Retrotran_gag_2

PF14223 Retrotran_gag_2 35-109 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057770807.1`	Pfam	`PF14223`	Retrotran_gag_2	Domain	35	109	9.6e-10	39.2	gag-polypeptide of LTR copia-type

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057914824.1
ATGTTGGAAGTCATCACCAAAGGACCAATCGTCATCACTGAAGTAGTTAAGAGCACTCCATTGGACACCACAAAAGATCCCTATGATGAAGTCCAGATCAAATCCAAAACTGACTTCACCACTGAAGAAAGAAAGCAAGACGAGCTAGATAATCTTGCTAAGAGTATCATCTTCGAAGCAGTCCCAGACAAATACGTCACCAAGATCATCAAATGCAAGACCGCAAAGGAGATGTGGGATATTCTTGAAAGATTGTGCAA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130990600
ATGTTGGAAGTCATCACCAAAGGACCAATCGTCATCACTGAAGTAGTTAAGAGCACTCCATTGGACACCACAAAAGATCCCTATGATGAAGTCCAGATCAAATCCAAAACTGACTTCACCACTGAAGAAAGAAAGCAAGACGAGCTAGATAATCTTGCTAAGAGTATCATCTTCGAAGCAGTCCCAGACAAATACGTCACCAAGATCATCAAATGCAAGACCGCAAAGGAGATGTGGGATATTCTTGAAAGATTGTGCAA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057770807.1
MLEVITKGPIVITEVVKSTPLDTTKDPYDEVQIKSKTDFTTEERKQDELDNLAKSIIFEAVPDKYVTKIIKCKTAKEMWDILERLCNELEKIKETKLSIACQKFDTFLMLKN

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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