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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr06G001633`

染色体: Chr06 坐标: 18302279-18303655 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr06G001633`
名称	SmilChr06G001633
描述	uncharacterized SmilChr06G001633
染色体 / SeqID	Chr06 / NC_080392.1
坐标与链方向	18302279 - 18303655 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130990601`
GeneID	`130990601`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130990601`
原始查询	`LOC130990601`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	confidence=no_hit
产物	confidence=no_hit
Arabidopsis	`-` -
Rice	`-` -
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF03732 (PEG10_N-capsid)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130990601

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057770808.1`
2	Nucleus	细胞核	0.60000	`XP_057770808.1`
3	Cytosol	细胞质基质	0.60000	`XP_057770808.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057770808.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057770808.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr6:18302348`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B84
`Chr6:18302367`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B52
`Chr6:18302394`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B107,B117,B13,B76,C59
`Chr6:18302424`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B62
`Chr6:18302451`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B105,C59
`Chr6:18302458`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	46	A21,A22,A4,A9,B10,B103,B106,B112,B125,B131,B135,B137,B139,B19,B31,B32,B38,B39,B47,B48,B52,B56,B63,B64,B83,B95,B96,B97,C13,C19,C21,C28,C39,C4,C56,C59,C6,C60,C73,C76,C77,C79,C87,D1,D5,D8
`Chr6:18302483`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A16,B3,B70,C62,C83
`Chr6:18302484`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B24,B4,C8
`Chr6:18302494`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B28,D10
`Chr6:18302498`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C17
`Chr6:18302504`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A5,C34,C75,D11
`Chr6:18302600`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B14,B45,B53

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057770808.1

458 aa

229

458

PEG10_N-capsid

PF03732 PEG10_N-capsid 94-168 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057770808.1`	Pfam	`PF03732`	PEG10_N-capsid	Domain	94	168	4.1e-11	43.8	Retrotransposon-derived protein PEG10, N-terminal capsid-like domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057914825.1
ATGGGTCAACCAGATAGAGCAAGGCGAACAGGCACACTTGGTCATAATGGCAGCATTCAAGATCAACCATTTCAGGTTGATCAGGGCCGACAGAGCATGTCCAACACCCTTCAAAATTTAGACCCCGCCTTGGTTAGAAGATTGGCGGATATGGAGGCCATCATCCAACGAATCCCAGGAGTCCCGGCCCCAATCAAGAAAAATGCAGAGAGCTGTTATGTTAACTCGCCCTTCGTGGATGAGATAGCTTTAGTGGAAAT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130990601
ATGGGTCAACCAGATAGAGCAAGGCGAACAGGCACACTTGGTCATAATGGCAGCATTCAAGATCAACCATTTCAGGTTGATCAGGGCCGACAGAGCATGTCCAACACCCTTCAAAATTTAGACCCCGCCTTGGTTAGAAGATTGGCGGATATGGAGGCCATCATCCAACGAATCCCAGGAGTCCCGGCCCCAATCAAGAAAAATGCAGAGAGCTGTTATGTTAACTCGCCCTTCGTGGATGAGATAGCTTTAGTGGAAAT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057770808.1
MGQPDRARRTGTLGHNGSIQDQPFQVDQGRQSMSNTLQNLDPALVRRLADMEAIIQRIPGVPAPIKKNAESCYVNSPFVDEIALVEMPKKFNFPHLKMFDGVSDPDDHIAQYCQRMFTVAIPRDMREACMCKGFGSSLIGSVLQWYTNLPNNSISSFAQLTDVFVQQYASSRKLEKISEVLYAIVQRHGEPLRDYIGCFNKKKVSITNCSEQTAVTAFRKGLLPGSDLYKTLTKYPCKTMEDMLIQAWAQIKWEKDQYNM...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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