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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr06G001682`

染色体: Chr06 坐标: 19075388-19078497 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr06G001682`
名称	SmilChr06G001682
描述	protein FAR1-RELATED SEQUENCE 5-like
染色体 / SeqID	Chr06 / NC_080392.1
坐标与链方向	19075388 - 19078497 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130990609`
GeneID	`130990609`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130990609`
原始查询	`LOC130990609`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	protein FAR1-RELATED SEQUENCE 5-like
产物	protein FAR1-RELATED SEQUENCE 5-like
Arabidopsis	`AT4G38180` (FRS5) FAR1-related sequence 5 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:829974] identity=30.9; qcov=0.398; evalue=2.57e-30; confidence=low
Rice	`Os04g0354200` - identity=23; qcov=0.805; evalue=2.07e-31; confidence=weak
GO	GO:0006355 (regulation of DNA-templated transcription); GO:0008270 (zinc ion binding)
KEGG	-
Pfam	PF03101 (FAR1); PF04434 (SWIM)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130990609

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057770816.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057770816.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057770816.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057770816.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057770816.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr6:19075395`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B24,C30
`Chr6:19075399`	`AC`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	70	A1,A15,A16,A20,A5,B1,B107,B11,B110,B112,B113,B118,B119,B126,B137,B139,B16,B19,B22,B30,B31,B32,B34,B40,B41,B48,B51,B53,B55,B60,B62,B64,B68,B69,B7,B79,B80,B86,B88,B9,B91,B93,B94,C12,C13,C15,C17,C21,C23,C25,C26,C29,C31,C35,C36,C37,C41,C42,C5,C52,C6,C7,C70,C71,C72,C77,C78,C79,C87,D3
`Chr6:19075400`	`C`	`CT`	1bp_insertion	frameshift_variant	2	B13,D4
`Chr6:19075400`	`C`	`CT`	1bp_insertion	CDS_variant	2	B13,D4
`Chr6:19075402`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	90	A10,A11,A14,A20,A22,A25,A5,A7,A8,A9,B1,B10,B104,B106,B112,B115,B117,B121,B123,B127,B128,B129,B133,B138,B139,B15,B17,B18,B20,B21,B24,B26,B31,B33,B35,B40,B42,B43,B49,B5,B54,B59,B6,B65,B75,B76,B79,B82,B85,B86,B87,B88,B9,B93,B96,B98,B99,C11,C26,C27,C28,C30,C34,C36,C40,C43,C45,C46,C48,C49,C5,C50,C51,C53,C54,C60,C67,C69,C76,C77,C78,C81,C82,C83,C84,C85,C86,D5,D7,D8
`Chr6:19075415`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B47,C14
`Chr6:19075450`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B19,D4
`Chr6:19075453`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B24,B33,B36,C63,C67
`Chr6:19075485`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C14,C25
`Chr6:19075497`	`C`	`CTA`	2bp_insertion	frameshift_variant	17	A19,B139,B29,B32,B53,B54,B63,B85,B94,B95,C34,C40,C43,C6,C62,C63,C8
`Chr6:19075525`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B4,C82
`Chr6:19075532`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B4,C82

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057770816.1

610 aa

305

610

FAR1

SWIM

PF03101 FAR1 43-138 aa PF04434 SWIM 443-467 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057770816.1`	Pfam	`PF03101`	FAR1	Domain	43	138	6.3e-21	75.6	FAR1 DNA-binding domain
`XP_057770816.1`	Pfam	`PF04434`	SWIM	Domain	443	467	9.4e-07	29.0	SWIM zinc finger

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057914833.1
ATGGATAACCCAGATTCAGAGCAAGAAGGCGAAATAGAATGTGACGCCAAATCATACCTTCCTGTTTGCGATTCCAGAAAGAAGCCTTACATGGGTCAACAATTCACGTCTGTAAATGACGCATATCAGTTTTATAAAAAATATGGATCTGCGTCGGGATTTGGAACTCGGTTGGGCTCAGCCAAAAAAGGGAAACATGGTCAAATATTGTATAGATATTTTATCTGTACAAGGGAGGGCTATAAACCGGAGTCCCAAAA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130990609
ATGGATAACCCAGATTCAGAGCAAGAAGGCGAAATAGAATGTGACGCCAAATCATACCTTCCTGTTTGCGATTCCAGAAAGAAGCCTTACATGGGTCAACAATTCACGTCTGTAAATGACGCATATCAGTTTTATAAAAAATATGGATCTGCGTCGGGATTTGGAACTCGGTTGGGCTCAGCCAAAAAAGGGAAACATGGTCAAATATTGTATAGATATTTTATCTGTACAAGGGAGGGCTATAAACCGGAGTCCCAAAA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057770816.1
MDNPDSEQEGEIECDAKSYLPVCDSRKKPYMGQQFTSVNDAYQFYKKYGSASGFGTRLGSAKKGKHGQILYRYFICTREGYKPESQKDVTESSTRKTKRRRKPSTRNSCKATIKVNLRDEDGKYVVTRFDESHNHELVSEECRPFMKQNRKIDQSHQMIMLRCAKANIGSMRAFRIFKELVGGYDDVGCTSKDFKNLSYDINSHADGFDAQLLLDRFISKRDCDDGFKCEYLTDEFDKVKSLFWCDSIGVQNYSVFGDAV...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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