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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G003182`

染色体: Chr01 坐标: 50592708-50607996 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G003182`
名称	SmilChr01G003182
描述	putative late blight resistance protein homolog R1A-10
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	50592708 - 50607996 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130990619`
GeneID	`130990619`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130990619`
原始查询	`LOC130990619`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	putative late blight resistance protein homolog R1A-10
产物	putative late blight resistance protein homolog R1A-10
Arabidopsis	`AT5G35450` (AT5G35450) Disease resistance protein (CC-NBS-LRR class) family [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:833508] identity=28.2; qcov=0.963; evalue=3.8e-64; confidence=low
Rice	`Os07g0186500` - identity=28.7; qcov=0.917; evalue=1.57e-68; confidence=low
GO	GO:0043531 (ADP binding); GO:0098542 (defense response to other organism)
KEGG	-
Pfam	PF00931 (NB-ARC); PF23559 (WHD_DRP)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130990619

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell membrane	细胞膜	0.80000	`XP_057770828.1`
2	Cytosol	细胞质基质	0.40000	`XP_057770825.1`
3	Cytoplasm	细胞质	0.20000	`XP_057770825.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057770828.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057770828.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:50593156`	`TGG`	`T`	2bp_deletion	frameshift_variant	1	C1
`Chr1:50593156`	`TGG`	`T`	2bp_deletion	CDS_variant	1	C1
`Chr1:50593264`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	6	B131,B78,C12,C32,C68,C8
`Chr1:50593352`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B49
`Chr1:50593466`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D7
`Chr1:50593544`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D6
`Chr1:50593565`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B100,B109,B140,B28,C25
`Chr1:50593644`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B80
`Chr1:50593705`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B73
`Chr1:50593754`	`T`	`TTG`	2bp_insertion	frameshift_variant	14	A11,B105,B108,B115,B122,B21,B27,B41,B75,B84,C12,C24,C60,C69
`Chr1:50593829`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C48,D4
`Chr1:50593855`	`C`	`CT`	1bp_insertion	frameshift_variant	1	C16

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057770825.1

865 aa

432

865

NB-ARC

WHD_DRP

PF00931 NB-ARC 153-320 aa PF23559 WHD_DRP 404-475 aa

XP_057770828.1

774 aa

387

774

NB-ARC

WHD_DRP

PF00931 NB-ARC 62-229 aa PF23559 WHD_DRP 313-384 aa

XP_057770830.1

774 aa

387

774

NB-ARC

WHD_DRP

PF00931 NB-ARC 62-229 aa PF23559 WHD_DRP 313-384 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057770825.1`	Pfam	`PF00931`	NB-ARC	Domain	153	320	2.2e-39	135.5	NB-ARC domain
`XP_057770825.1`	Pfam	`PF23559`	WHD_DRP	Domain	404	475	1.6e-17	64.0	Disease resistance protein Winged helix domain
`XP_057770828.1`	Pfam	`PF00931`	NB-ARC	Domain	62	229	1.9e-39	135.7	NB-ARC domain
`XP_057770828.1`	Pfam	`PF23559`	WHD_DRP	Domain	313	384	1.2e-17	64.4	Disease resistance protein Winged helix domain
`XP_057770830.1`	Pfam	`PF00931`	NB-ARC	Domain	62	229	1.9e-39	135.7	NB-ARC domain
`XP_057770830.1`	Pfam	`PF23559`	WHD_DRP	Domain	313	384	1.2e-17	64.4	Disease resistance protein Winged helix domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

3 records

下载 cDNA FASTA

XM_057914845.1
CATCAGAAACTGGTCTTCTCACCACCCATAAAAAGAAAAAACACAATTATATTCTCTATGGCCTGACGTCTGTGTGCTAAGGAAAGGTCAAGGAAGAGAAATCAATTTCTTTTTCATCAATTGCTATGGCTTATCAAGTGTCTACCCCTGTTGCTCTTCATTCCCATGCTTTGTCAACTTCTCTAATTGGTCTAAACAAATCTGATTTCACCTTGGTGTATTGGATCTTGATTCAGCACTTGAGGTTGAAGAGCCTACTA...

XM_057914847.1
TGTCGTTTCAATGACATGTTCATGCATGCTACGAGAACCATCAAATTTCATCAGCGTAGCCATTAAGGTCATAGCAACAGACTTGTCAGCAGTCTGTGAACGTTCTTTCACAGAATTCATGAATTCCTTAGCACTTTTAGTTTTAGGAATGATAAACTTGATGTTGTCTGCTACACTCCTAAGCATATTCAATAGGAATGGGTTGTATTCAGGGGGAAGTGAGTTTTCACACTTCCCCCTGCTTGAGGAAATACAATTCG...

CDS

3 records

下载 CDS FASTA

LOC130990619
ATGGCAGCTTATGCAGCTCTGGTTTCTGTTATGCATATCATAGATAACCTTCAGCTTCATCCTCGCCCTCCTATTTCTCTACACCTTAAACAACTTCACTCTCTCACTCAAAAGCTTACTTTCCTCCTAGAATTTCTCGAAGGTTATAACCCTCATCTTGGCTACACCACAGAAGCAGATCCCTTGGAGAGTCGCATTGCAGATGCAGCTCATGCAGCTGAAGACGTGATTGAGTCTCACATTGTGGATCAGATCACAAG...

LOC130990619
ATGAGCTCCGACGCCTTGTATGAAGCTCTAGAGAAGGTGATCGAAGATATGGCGTTGATCGAAAAGGAGGCCATGGAAATCAAAGAGACTGTGGGAGTCCGACATCAGCTGCACAGAAAATCAACACCTCGATCTTCGTCGATTGGGAAGAAGAAGAAGAGTAGGATGGTGGGTGTTGATGATGTCTTGTATGCTTTGAAGGATAAGCTCACTTCTCATAGCAAAGATCTACAAATCATTCCTATTGCAGGGATGGGTGG...

Protein

3 records

下载 Protein FASTA

XP_057770825.1
MAAYAALVSVMHIIDNLQLHPRPPISLHLKQLHSLTQKLTFLLEFLEGYNPHLGYTTEADPLESRIADAAHAAEDVIESHIVDQITSEGEKMSSDALYEALEKVIEDMALIEKEAMEIKETVGVRHQLHRKSTPRSSSIGKKKKSRMVGVDDVLYALKDKLTSHSKDLQIIPIAGMGGLGKTTLALNLYQDRLITHHFNICVWATISQEYTIRGILAQLLRQLIDEESGHDLSVSVLGNKLYQHLYSRRFLIVLDDMWSI...

XP_057770828.1
MSSDALYEALEKVIEDMALIEKEAMEIKETVGVRHQLHRKSTPRSSSIGKKKKSRMVGVDDVLYALKDKLTSHSKDLQIIPIAGMGGLGKTTLALNLYQDRLITHHFNICVWATISQEYTIRGILAQLLRQLIDEESGHDLSVSVLGNKLYQHLYSRRFLIVLDDMWSINAWDGVRNYFPDNKNGSRIVVTTRLSNLAVKLTNSHSLGLKLLNEADSWELLSKTVFGEDVCPPELEEIGKKIAKGCKGLPLSIVVVGGFL...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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