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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr06G001701`

染色体: Chr06 坐标: 19565969-19567708 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr06G001701`
名称	SmilChr06G001701
描述	protein FAR1-RELATED SEQUENCE 5-like
染色体 / SeqID	Chr06 / NC_080392.1
坐标与链方向	19565969 - 19567708 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130990621`
GeneID	`130990621`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130990621`
原始查询	`LOC130990621`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	protein FAR1-RELATED SEQUENCE 5-like
产物	protein FAR1-RELATED SEQUENCE 5-like
Arabidopsis	`AT4G38180` (FRS5) FAR1-related sequence 5 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:829974] identity=30.1; qcov=0.712; evalue=1.17e-57; confidence=low
Rice	`Os06g0166100` - identity=36.1; qcov=0.799; evalue=4.5e-87; confidence=medium
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF10551 (MULE); PF21056 (ZSWIM1-3_RNaseH-like)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130990621

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057770823.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.20000	`XP_057770823.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057770823.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057770823.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057770823.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr6:19566051`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B69,B91
`Chr6:19566101`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B82
`Chr6:19566164`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	1	D6
`Chr6:19566164`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D6
`Chr6:19566267`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	C27,C34,C75,C82
`Chr6:19566285`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B104,B61,C47
`Chr6:19566293`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A14,B57
`Chr6:19566444`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B3,C62
`Chr6:19566445`	`C`	`CT`	1bp_insertion	frameshift_variant	13	B119,B22,B30,B31,B32,B34,B48,B79,C15,C20,C36,C53,C79
`Chr6:19566531`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B51,B53
`Chr6:19566539`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A14,B57
`Chr6:19566555`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B61,C47

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057770823.1

513 aa

256

513

ZSWIM1-3_RNaseH-like

MULE

PF21056 ZSWIM1-3_RNaseH-like 215-328 aa PF10551 MULE 245-339 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057770823.1`	Pfam	`PF21056`	ZSWIM1-3_RNaseH-like	Domain	215	328	1.8e-10	41.5	Zinc finger SWIM domain-containing protein 1/3, RNaseH-like domain
`XP_057770823.1`	Pfam	`PF10551`	MULE	Domain	245	339	9.5e-29	100.4	MULE transposase domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057914840.1
ATGGATTTTAATTTGAACGAGTATCCAACTAATGATGTTGGCGATGAAGATGAAGTATCGTCAAGGAAGGAAGCATTTTTTGATGAAAATAATGTTGTAAATGGAAAAGGAGATTGTGATGATAATTCAGATGTTGGAGACGGAGATAAGGATGAAAGCGTTGAAGAAGTTGAGGAAAATGTTGAAGATGAGCAACATGTTGAGCATGATTGTGCCAATTTTGTCGATCTACTTAATAGGATTGATGTACTTGAGATGGT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130990621
ATGGATTTTAATTTGAACGAGTATCCAACTAATGATGTTGGCGATGAAGATGAAGTATCGTCAAGGAAGGAAGCATTTTTTGATGAAAATAATGTTGTAAATGGAAAAGGAGATTGTGATGATAATTCAGATGTTGGAGACGGAGATAAGGATGAAAGCGTTGAAGAAGTTGAGGAAAATGTTGAAGATGAGCAACATGTTGAGCATGATTGTGCCAATTTTGTCGATCTACTTAATAGGATTGATGTACTTGAGATGGT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057770823.1
MDFNLNEYPTNDVGDEDEVSSRKEAFFDENNVVNGKGDCDDNSDVGDGDKDESVEEVEENVEDEQHVEHDCANFVDLLNRIDVLEMVLEVGKSEAAHILYCESETKTSLDRWMATYKKQDRKTMCKAKLRVARRRNQPWKKLLIEAMNSAGIGISRACAFIEKESGGPQNCGFTRKDAYNHINGLKMKTKVENGDANSLIQYFSKMSNSEAFFYFDFQVDDEGRLMNFFFRDSRSSLDYDYFGDVLSVDSTYRTNRYKLV...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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