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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr06G001816`

染色体: Chr06 坐标: 21323906-21326413 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr06G001816`
名称	SmilChr06G001816
描述	protein FAR1-RELATED SEQUENCE 5-like
染色体 / SeqID	Chr06 / NC_080392.1
坐标与链方向	21323906 - 21326413 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130990635`
GeneID	`130990635`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130990635`
原始查询	`LOC130990635`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	protein FAR1-RELATED SEQUENCE 5-like
产物	protein FAR1-RELATED SEQUENCE 5-like
Arabidopsis	`AT4G38180` (FRS5) FAR1-related sequence 5 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:829974] identity=29.9; qcov=0.831; evalue=7.48e-91; confidence=low
Rice	`Os06g0166100` - identity=34.3; qcov=0.802; evalue=7.17e-115; confidence=low
GO	GO:0006355 (regulation of DNA-templated transcription); GO:0008270 (zinc ion binding)
KEGG	-
Pfam	PF03101 (FAR1); PF10551 (MULE)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130990635

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057770842.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.20000	`XP_057770842.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057770842.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057770842.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057770842.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr6:21323945`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B101
`Chr6:21323992`	`CGT`	`C`	2bp_deletion	frameshift_variant	19	A1,B123,B13,B131,B19,B35,B43,B49,B6,B70,B72,C19,C23,C4,C44,C57,C64,C74,C9
`Chr6:21323995`	`A`	`AAG`	2bp_insertion	frameshift_variant	19	A1,B123,B13,B131,B19,B35,B43,B49,B6,B70,B72,C19,C23,C4,C44,C57,C64,C74,C9
`Chr6:21324038`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A15
`Chr6:21324210`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A5,B1
`Chr6:21324235`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B136
`Chr6:21324296`	`T`	`TG`	1bp_insertion	frameshift_variant	11	A21,A9,B1,B126,B20,B74,B77,B8,B85,B9,C22
`Chr6:21324327`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C63,D7
`Chr6:21324337`	`AAC`	`A`	2bp_deletion	frameshift_variant	1	B93
`Chr6:21324337`	`AAC`	`A`	2bp_deletion	CDS_variant	1	B93
`Chr6:21324369`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	2	B111,B69
`Chr6:21324369`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B111,B69

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057770842.1

712 aa

356

712

FAR1

MULE

PF03101 FAR1 103-192 aa PF10551 MULE 314-408 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057770842.1`	Pfam	`PF03101`	FAR1	Domain	103	192	6.6e-22	78.8	FAR1 DNA-binding domain
`XP_057770842.1`	Pfam	`PF10551`	MULE	Domain	314	408	2.5e-24	86.2	MULE transposase domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057914859.1
ATGCCAAACCATCATCTCTTGATCATCTTGGCAATAGGTCTGAGATGGGGATGCAGTCTTGACATGCTCAAAACGTTCTTGATGTTCGTATTGGATGAGGCATCATCCATCAGGGTATCTCTCATGAGATTGGTGGCTTCTTCATCTGAGAAGATTGGAGCAGACGTTAAATCTGAATTTCTCCATGAGACTGAAGATGTGGCCAATGAAGTTGGTCATTCAACTGCTGTAGAGTTGGAGGCTGTAGAGTTGGAGGCGAA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130990635
ATGCCAAACCATCATCTCTTGATCATCTTGGCAATAGGTCTGAGATGGGGATGCAGTCTTGACATGCTCAAAACGTTCTTGATGTTCGTATTGGATGAGGCATCATCCATCAGGGTATCTCTCATGAGATTGGTGGCTTCTTCATCTGAGAAGATTGGAGCAGACGTTAAATCTGAATTTCTCCATGAGACTGAAGATGTGGCCAATGAAGTTGGTCATTCAACTGCTGTAGAGTTGGAGGCTGTAGAGTTGGAGGCGAA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057770842.1
MPNHHLLIILAIGLRWGCSLDMLKTFLMFVLDEASSIRVSLMRLVASSSEKIGADVKSEFLHETEDVANEVGHSTAVELEAVELEAKLAPGCLVDGLDEAFLLYCDYAKHTGFSVRKGNQERFSKTKEVRMKTFVCSCRGLTPTTHIEGRLAVYKKHSSRCNCQALLRIARVEGGPWKVTTFIKDHNHELFPKDQAYLLSSSRHISHTKKSMLEALHSAGIPISRACRFMENEAGGPENTGFIRRDVYHHMDNVRRKSKM...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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