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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr06G001836`

染色体: Chr06 坐标: 21556603-21560065 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr06G001836`
名称	SmilChr06G001836
描述	protein FAR1-RELATED SEQUENCE 5-like
染色体 / SeqID	Chr06 / NC_080392.1
坐标与链方向	21556603 - 21560065 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130990640`
GeneID	`130990640`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130990640`
原始查询	`LOC130990640`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	protein FAR1-RELATED SEQUENCE 5-like
产物	protein FAR1-RELATED SEQUENCE 5-like
Arabidopsis	`AT4G38180` (FRS5) FAR1-related sequence 5 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:829974] identity=29; qcov=0.67; evalue=1.17e-86; confidence=low
Rice	`Os06g0166100` - identity=35; qcov=0.657; evalue=1.92e-115; confidence=low
GO	GO:0008270 (zinc ion binding)
KEGG	-
Pfam	PF03101 (FAR1); PF10551 (MULE); PF21056 (ZSWIM1-3_RNaseH-like)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130990640

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057770848.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057770848.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057770848.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057770848.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057770848.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr6:21556747`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B27
`Chr6:21556909`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A25,B32,B8,C12,C66
`Chr6:21557026`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A14,B57,C49,C50
`Chr6:21557041`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B113,B126,B21,C12,C60
`Chr6:21557150`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B124,B49,B79
`Chr6:21557154`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B121,B75,C4
`Chr6:21557173`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B106,B24,B67,B73
`Chr6:21557203`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B27
`Chr6:21557209`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B140,B15,B41,C15
`Chr6:21557229`	`AT`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B77
`Chr6:21557229`	`AT`	`A`	1bp_deletion	CDS_variant	1	B77
`Chr6:21557355`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B131,B6

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057770848.1

922 aa

461

922

FAR1

ZSWIM1-3_RNaseH-like

MULE

PF03101 FAR1 103-194 aa PF21056 ZSWIM1-3_RNaseH-like 286-399 aa PF10551 MULE 316-410 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057770848.1`	Pfam	`PF03101`	FAR1	Domain	103	194	2e-14	54.8	FAR1 DNA-binding domain
`XP_057770848.1`	Pfam	`PF21056`	ZSWIM1-3_RNaseH-like	Domain	286	399	2.5e-08	34.6	Zinc finger SWIM domain-containing protein 1/3, RNaseH-like domain
`XP_057770848.1`	Pfam	`PF10551`	MULE	Domain	316	410	2.5e-28	99.0	MULE transposase domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057914865.1
ATGGATTTTAATTTGAACGAGTATCCAACTAATGATGTTGGCGATGAAGATGAAGTATCGTCAAGGAAGGAAGCATTTGTTGATGAAAATAATGTTGAAAATAGAAACGAAGATTGTGATGATAATTCAGATGTTGGAGACGGAGATAAGGATGAAAGCGTTGAAGAAGTTGAGGAAAATGTTGAAGATGAGCAACATGTTGAGCATGATTGTGCCAATTTTGTCGATCTACTTAATAGGATTGATGTACTTGAGATGGT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130990640
ATGGATTTTAATTTGAACGAGTATCCAACTAATGATGTTGGCGATGAAGATGAAGTATCGTCAAGGAAGGAAGCATTTGTTGATGAAAATAATGTTGAAAATAGAAACGAAGATTGTGATGATAATTCAGATGTTGGAGACGGAGATAAGGATGAAAGCGTTGAAGAAGTTGAGGAAAATGTTGAAGATGAGCAACATGTTGAGCATGATTGTGCCAATTTTGTCGATCTACTTAATAGGATTGATGTACTTGAGATGGT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057770848.1
MDFNLNEYPTNDVGDEDEVSSRKEAFVDENNVENRNEDCDDNSDVGDGDKDESVEEVEENVEDEQHVEHDCANFVDLLNRIDVLEMVLEVGKSVNDPEAAHILYCEYARLKGFSVTRDNKGYFNHTKICSFQTFLCSCHGRSETKTSLATRGMATYKKQDRKTMCKAKLRVARRRNQPWKVSSWYREHNHELFPSGQSYLLRSARSVSKCKKLLIEAMNSAGIGISRACAFIEKESGGPQNCGFTRKDAYNHINGLKMKT...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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