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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr06G001865`

染色体: Chr06 坐标: 22066380-22067914 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr06G001865`
名称	SmilChr06G001865
描述	RNA-binding protein Y14A-like
染色体 / SeqID	Chr06 / NC_080392.1
坐标与链方向	22066380 - 22067914 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130990644`
GeneID	`130990644`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130990644`
原始查询	`LOC130990644`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	RNA-binding protein Y14A-like
产物	RNA-binding protein Y14A-like
Arabidopsis	`AT1G51510` (Y14) RNA-binding (RRM/RBD/RNP motifs) family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:841576] identity=68.9; qcov=1.02; evalue=4.17e-70; confidence=high
Rice	`Os05g0140500` (OsY14a) - identity=71.9; qcov=0.695; evalue=4.56e-53; confidence=high
GO	GO:0003729 (mRNA binding); GO:0005634 (nucleus); GO:0005737 (cytoplasm); GO:0008380 (RNA splicing); GO:0035145 (exon-exon junction complex)
KEGG	smil03013 (Nucleocytoplasmic transport - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil03015 (mRNA surveillance pathway - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil03040 (Spliceosome - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF00076 (RRM_1)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130990644

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057770853.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.80000	`XP_057770853.1`
3	Nucleoplasm	核质	0.40000	`XP_057770853.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057770853.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057770853.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr6:22066447`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B139
`Chr6:22066469`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B92,D7
`Chr6:22067186`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B65
`Chr6:22067188`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B71,C48,C58
`Chr6:22067258`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C22,C44

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057770853.1

164 aa

164

RRM_1

PF00076 RRM_1 95-159 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057770853.1`	Pfam	`PF00076`	RRM_1	Domain	95	159	5.5e-16	58.9	RNA recognition motif

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057914870.1
CCCTTTAGCCCTTCCCCTCCTATCCCCAAATCTAAACCTAGCTAAATATCTGCTTCAATGGCGAATGCGGAGGCGGAGGCCGTCGATTTCGAGCCTGAGGAGGACGATCTTATGGACGAGGATGTCGGCGATGGCTCCCCCAACCGAGCAACCGTTCCTCGCCTGAAGTCCGCCATCACCGGCGGCGGCTCCTCCACCGCTCCAAAGAAGACCAAGGGCCGCGGGTTTCGCGACGAGGCCGCTGCTGAAGCGGACCGAAA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130990644
ATGGCGAATGCGGAGGCGGAGGCCGTCGATTTCGAGCCTGAGGAGGACGATCTTATGGACGAGGATGTCGGCGATGGCTCCCCCAACCGAGCAACCGTTCCTCGCCTGAAGTCCGCCATCACCGGCGGCGGCTCCTCCACCGCTCCAAAGAAGACCAAGGGCCGCGGGTTTCGCGACGAGGCCGCTGCTGAAGCGGACCGAAATGCTCGCATGTCCGCCCCCTTCGATTCGCTCGATTCAGAAGGCGGTCCTGGCCCCGA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057770853.1
MANAEAEAVDFEPEEDDLMDEDVGDGSPNRATVPRLKSAITGGGSSTAPKKTKGRGFRDEAAAEADRNARMSAPFDSLDSEGGPGPERSIEGWIILVTGVHEEAQEEDLQNAFGDFGEIKNLHLNLDRPTGFVKGYALIEFEKFEEAQRAINEMNGTELLTVAA

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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