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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr06G001869`

染色体: Chr06 坐标: 22097534-22098529 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr06G001869`
名称	SmilChr06G001869
描述	uncharacterized SmilChr06G001869
染色体 / SeqID	Chr06 / NC_080392.1
坐标与链方向	22097534 - 22098529 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130990645`
GeneID	`130990645`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130990645`
原始查询	`LOC130990645`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	Ribonuclease H-like superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:820108]; symbol=AT3G09510; hit=AT3G09510; species=arabidopsis; confidence=low
产物	Ribonuclease H-like superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:820108]; symbol=AT3G09510; hit=AT3G09510; species=arabidopsis; confidence=low
Arabidopsis	`AT3G09510` (AT3G09510) Ribonuclease H-like superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:820108] identity=31; qcov=0.976; evalue=3.87e-33; confidence=low
Rice	`Os01g0930300` - identity=23.8; qcov=0.903; evalue=6.49e-14; confidence=weak
GO	GO:0003676 (nucleic acid binding); GO:0004523 (RNA-DNA hybrid ribonuclease activity)
KEGG	-
Pfam	PF13456 (RVT_3); PF13966 (zf-RVT)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130990645

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	0.60000	`XP_057770854.1`
2	Nucleus	细胞核	0.40000	`XP_057770854.1`
3	Cytosol	细胞质基质	0.40000	`XP_057770854.1`
4	Cell membrane	细胞膜	0.20000	`XP_057770854.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057770854.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr6:22097585`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B28,B64,B86,C27
`Chr6:22097615`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C46
`Chr6:22097675`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B114
`Chr6:22097704`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B104,C34
`Chr6:22097752`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	10	A1,A6,B40,B56,B83,C19,C59,C73,C77,D8
`Chr6:22097906`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B2
`Chr6:22097915`	`GA`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	93	A11,A13,A2,A21,A23,A24,A3,A8,A9,B102,B104,B105,B107,B109,B11,B111,B115,B117,B121,B122,B123,B125,B127,B129,B131,B133,B137,B138,B18,B20,B21,B25,B28,B31,B35,B38,B39,B41,B48,B49,B5,B53,B54,B55,B59,B6,B63,B66,B73,B76,B79,B80,B85,B87,B88,B89,B9,B93,B94,B95,B97,B99,C11,C16,C22,C23,C27,C28,C3,C31,C33,C34,C43,C50,C51,C52,C54,C56,C58,C60,C61,C65,C67,C69,C70,C76,C78,C80,C83,C84,C9,D2,D5
`Chr6:22097945`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B7,C1,C79
`Chr6:22097953`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B104,C34
`Chr6:22097955`	`CT`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	21	A21,A22,B10,B104,B107,B130,B20,B48,B54,B60,B63,B75,C10,C17,C53,C71,C73,C74,C80,C83,D6
`Chr6:22097957`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B78,D4
`Chr6:22098012`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C58

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057770854.1

331 aa

166

331

zf-RVT

RVT_3

PF13966 zf-RVT 8-73 aa PF13456 RVT_3 182-304 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057770854.1`	Pfam	`PF13966`	zf-RVT	Domain	8	73	2.2e-17	64.2	zinc-binding in reverse transcriptase
`XP_057770854.1`	Pfam	`PF13456`	RVT_3	Domain	182	304	1.3e-17	64.5	Reverse transcriptase-like

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057914871.1
ATGCATGGTGTTGATGGTCTCTGGGGCAGACTTTGGAAGACTAATGTCCCTCCTAAAGTGCGAAGCTTTCTTTGGCGAGCTGCCCGCAACAACCTTCCCTCCAAGGAACGGCTGCTTTCTAGAGGAGTTGCGGTTGGGGGCGAGTGCGAGACGTGCAAAAGCAGCTTTGAGAACCTTTGGCACACCTTTTTCTTTTGCTCTTTTGCTGAGGACTGCTGGAGGTGTAGTGATTTGGGGCAGTACATCAGCAACATTACCAA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130990645
ATGCATGGTGTTGATGGTCTCTGGGGCAGACTTTGGAAGACTAATGTCCCTCCTAAAGTGCGAAGCTTTCTTTGGCGAGCTGCCCGCAACAACCTTCCCTCCAAGGAACGGCTGCTTTCTAGAGGAGTTGCGGTTGGGGGCGAGTGCGAGACGTGCAAAAGCAGCTTTGAGAACCTTTGGCACACCTTTTTCTTTTGCTCTTTTGCTGAGGACTGCTGGAGGTGTAGTGATTTGGGGCAGTACATCAGCAACATTACCAA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057770854.1
MHGVDGLWGRLWKTNVPPKVRSFLWRAARNNLPSKERLLSRGVAVGGECETCKSSFENLWHTFFFCSFAEDCWRCSDLGQYISNITNSCDSFVEALFCIIGGNNEELTARVCMVLWQIWKDRNRAIWEGVFPVPARSVLQAAEARIEWLLAREKRSVQHPSSSPAVTCGGWHPLPLEYVKCNVDATFFSDINAVGIGIVVRSHDGNFVTGKSMKLMGLRRVDEGELIGIKEALSWLKFLGLSRGWVESDCKRACEALCSS...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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