当前解析结果
SmilChr06G001885| 统一新 Gene ID | SmilChr06G001885 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr06G001885 |
| 描述 | uncharacterized SmilChr06G001885 |
| 染色体 / SeqID | Chr06 / NC_080392.1 |
| 坐标与链方向 | 22513507 - 22515887 / + |
| NCBI Gene ID | LOC130990650 |
|---|---|
| GeneID | 130990650 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC130990650 |
| 原始查询 | LOC130990650 |
| 来源 | GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | hit=Os06g0523701; species=rice; confidence=low |
| 产物 | hit=Os06g0523701; species=rice; confidence=low |
| Arabidopsis | -- |
| Rice | Os06g0523701- identity=40; qcov=0.37; evalue=2.91e-29; confidence=low |
| GO | GO:0003676 (nucleic acid binding) |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:130990650 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Nucleus | 细胞核 | 1.00000 | XP_057770858.1 |
| 2 | Chromosome | 染色体 | 0.20000 | XP_057770858.1 |
| 3 | Telomere | 端粒 | 0.20000 | XP_057770858.1 |
| 4 | Centromere | 着丝粒 | 0.00000 | XP_057770858.1 |
| 5 | Chromatin | 染色质 | 0.00000 | XP_057770858.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr6:22513511 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | A20 |
Chr6:22514922 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 5 | B24,B66,B98,C58,C73 |
Chr6:22515004 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B19 |
Chr6:22515011 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | B100,B19,B23,B87 |
Chr6:22515020 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 5 | A1,B129,B26,C36,C40 |
Chr6:22515075 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B10 |
Chr6:22515104 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | A19,B122,B2,B23 |
Chr6:22515107 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | stop_gained | 9 | B106,B118,B125,B62,B67,B77,C18,C63,C87 |
Chr6:22515123 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B2,B23 |
Chr6:22515150 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B104 |
Chr6:22515173 |
TCG |
T |
2bp_deletion | frameshift_variant | 12 | A13,A16,B130,B131,B14,C14,C29,C30,C32,C48,C68,C74 |
Chr6:22515205 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B101,C85 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。