Gene Card 基因详情

支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID,以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因,再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。
示例

当前解析结果

SmilChr06G001911

染色体: Chr06 坐标: 23091585-23092097 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene IDSmilChr06G001911
名称SmilChr06G001911
描述uncharacterized SmilChr06G001911
染色体 / SeqIDChr06 / NC_080392.1
坐标与链方向23091585 - 23092097 / +

ID 对照

NCBI Gene IDLOC130990655
GeneID130990655
locus_tag-
NCBI NameLOC130990655
原始查询LOC130990655

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述zinc ion binding / nucleic acid binding protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:814629]; symbol=AT2G01050; hit=AT2G01050; species=arabidopsis; confidence=low
产物zinc ion binding / nucleic acid binding protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:814629]; symbol=AT2G01050; hit=AT2G01050; species=arabidopsis; confidence=low
ArabidopsisAT2G01050 (AT2G01050)
zinc ion binding / nucleic acid binding protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:814629]
identity=25.8; qcov=0.571; evalue=2.55e-06; confidence=low
Rice-
-
GO-
KEGG-
PfamPF14111 (DUF4283)
InterPro-
eggNOG-
NRGeneID:130990655

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank定位位置中文ScoreProtein ID
1 Chloroplast 叶绿体 0.80000 XP_057770865.1
2 Cytoplasm 细胞质 0.40000 XP_057770865.1
3 Cytosol 细胞质基质 0.20000 XP_057770865.1
4 Nucleus 细胞核 0.00000 XP_057770865.1
5 Chromosome 染色体 0.00000 XP_057770865.1

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

该基因暂未检索到已上线的精选 EMS CDS / LoF 突变,或 EMS 突变库仍在构建。

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan;位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057770865.1
170 aa
N
1
85
170
DUF4283
C
PF14111 DUF4283 42-127 aa
Protein ID 来源 结构域编号 结构域名称 类型 起始 aa 终止 aa E-value Score 说明
XP_057770865.1 Pfam PF14111 DUF4283 Domain 42 127 1.3e-07 31.9 Domain of unknown function (DUF4283)

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA(仅基因区域)

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA
XM_057914882.1
ATGCAAAACCGGGTTGAACGACCTCCAGATTTACCGGCGCATAAATTCTCAGCTCTTAAGGCCGAGAAACTTGCTGATGGGTTCTCTCTCACCATTCCAAAACAGATGTATCAAAAACGTATTGCTGAATTCAAATTCTCTGTTATTGGAAGGGTGTTACTACGGAAAGGAAGCAAGCCACAGGCGACACATCAGTTGAAGCTTGAACTCAACAATTTGTGGGGTATCCAATCAGAGTGGAAGCTTCTCACTTTGGGTAA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA
LOC130990655
ATGCAAAACCGGGTTGAACGACCTCCAGATTTACCGGCGCATAAATTCTCAGCTCTTAAGGCCGAGAAACTTGCTGATGGGTTCTCTCTCACCATTCCAAAACAGATGTATCAAAAACGTATTGCTGAATTCAAATTCTCTGTTATTGGAAGGGTGTTACTACGGAAAGGAAGCAAGCCACAGGCGACACATCAGTTGAAGCTTGAACTCAACAATTTGTGGGGTATCCAATCAGAGTGGAAGCTTCTCACTTTGGGTAA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA
XP_057770865.1
MQNRVERPPDLPAHKFSALKAEKLADGFSLTIPKQMYQKRIAEFKFSVIGRVLLRKGSKPQATHQLKLELNNLWGIQSEWKLLTLGKGFFTMKFSTLEDKKLAKTKIVWDLAAGSIRLRDWVPCFNPYKEVSSICQVWVRIYYLPNEFWDPKVITAIARIIGFCHTPILE

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

JBrowse

跳转到基因组浏览器