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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G003185`

染色体: Chr01 坐标: 50608272-50610918 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G003185`
名称	SmilChr01G003185
描述	zinc finger CCCH domain-containing protein 62
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	50608272 - 50610918 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130990662`
GeneID	`130990662`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130990662`
原始查询	`LOC130990662`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	zinc finger CCCH domain-containing protein 62
产物	zinc finger CCCH domain-containing protein 62
Arabidopsis	`AT5G66840` (AT5G66840) SAP domain-containing protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:836818] identity=52; qcov=0.457; evalue=8.82e-65; confidence=medium
Rice	`Os10g0391300` (OsC3H62) - identity=48.1; qcov=0.655; evalue=4.61e-81; confidence=high
GO	GO:0046872 (metal ion binding)
KEGG	-
Pfam	PF00642 (zf-CCCH); PF02037 (SAP); PF24766 (DUF7699)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130990662

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057770871.1`
2	Nuclear body	核内小体	0.20000	`XP_057770871.1`
3	Nuclear speckle	核斑点	0.20000	`XP_057770871.1`
4	Nucleoplasm	核质	0.20000	`XP_057770871.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057770871.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:50609623`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr1:50610328`	`C`	`CG`	1bp_insertion	frameshift_variant	2	B56,B96
`Chr1:50610328`	`C`	`CG`	1bp_insertion	CDS_variant	2	B56,B96
`Chr1:50610362`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B41

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057770871.1

438 aa

219

438

SAP

DUF7699

zf-CCCH

PF02037 SAP 87-120 aa PF24766 DUF7699 145-231 aa PF00642 zf-CCCH 416-435 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057770871.1`	Pfam	`PF02037`	SAP	Domain	87	120	8.3e-10	38.8	SAP domain
`XP_057770871.1`	Pfam	`PF24766`	DUF7699	Domain	145	231	7.3e-43	145.8	Domain of unknown function (DUF7699)
`XP_057770871.1`	Pfam	`PF00642`	zf-CCCH	Family	416	435	8.2e-05	23.1	Zinc finger C-x8-C-x5-C-x3-H type (and similar)

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057914888.1
GGCCCAAAAGTTCAAAATCCATTTTGAGAAGCCTCTTCAATTTTTGCAACGGTTACATTTTCCGGAAATGGAAGACAGCACACAAATCAACGAAGTGAAGCCAACTTAAAACTCCCAAAAATCCCTGTTTTTTGAAGCGGTCTCAACATTTCGATTTGGATAATGGATTTTTCAGAGGAAGACTGTCTCAGTGAATCCGAATCCAGTTCGCGATTCTCCGATGATTCGCAAAACGACCCGGATTTCGATATCGAGGAGAC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130990662
ATGGATTTTTCAGAGGAAGACTGTCTCAGTGAATCCGAATCCAGTTCGCGATTCTCCGATGATTCGCAAAACGACCCGGATTTCGATATCGAGGAGACCACGTTGACGCTCTCAAATCTCTCGCTAAAGAGGAAATCAAAGAGATCGAAGATCAATGGTGATGAGGAAATGGATGTTGAAGAAGAGGGAGATGAGCTTGATGAGAAGGATAAAAAGAGCTATGAAATTATTCAGAAAATCATCGAAGATGGTAGGGTTGA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057770871.1
MDFSEEDCLSESESSSRFSDDSQNDPDFDIEETTLTLSNLSLKRKSKRSKINGDEEMDVEEEGDELDEKDKKSYEIIQKIIEDGRVDRLKVEQCKIYLRKHGLRLSGKKETLIERIKEHVDIVNGGGEAKYPASSFVLNCKGDACKGDIVIFEQNVYEEFSIVSRSATAGPLGTRIVAGRILKESYGAAKQQHTFTIEVLWSKGEKPLPPLHPLLIKGRNLYRLKTMRQKWEDEGERQRILFEKHARGDAARSNREVRIQ...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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