当前解析结果
SmilChr06G001960| 统一新 Gene ID | SmilChr06G001960 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr06G001960 |
| 描述 | uncharacterized SmilChr06G001960 |
| 染色体 / SeqID | Chr06 / NC_080392.1 |
| 坐标与链方向 | 24427877 - 24428932 / + |
| NCBI Gene ID | LOC130990669 |
|---|---|
| GeneID | 130990669 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC130990669 |
| 原始查询 | LOC130990669 |
| 来源 | GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | confidence=no_hit |
| 产物 | confidence=no_hit |
| Arabidopsis | -- |
| Rice | -- |
| GO | - |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:130990669 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Cytoplasm | 细胞质 | 1.00000 | XP_057770876.1 |
| 2 | Nucleus | 细胞核 | 0.60000 | XP_057770876.1 |
| 3 | Cytoplasmic granule | 细胞质颗粒 | 0.60000 | XP_057770876.1 |
| 4 | Cytoplasmic ribonucleoprotein granule | Cytoplasmic ribonucleoprotein granule | 0.40000 | XP_057770876.1 |
| 5 | Stress granule | Stress granule | 0.20000 | XP_057770876.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr6:24427895 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | stop_gained | 58 | A10,A16,A18,A6,B101,B102,B112,B119,B127,B132,B135,B2,B25,B26,B27,B31,B33,B34,B35,B36,B38,B39,B4,B40,B44,B51,B56,B69,B74,B78,B81,B95,B96,C1,C21,C23,C26,C31,C34,C4,C40,C42,C47,C55,C57,C6,C61,C62,C64,C66,C7,C73,C78,C79,C8,C85,D7,D9 |
Chr6:24427910 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B101,D7 |
Chr6:24427919 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | D4 |
Chr6:24427932 |
T |
TCA |
2bp_insertion | frameshift_variant | 1 | C35 |
Chr6:24427932 |
T |
TCA |
2bp_insertion | CDS_variant | 1 | C35 |
Chr6:24427935 |
T |
TG |
1bp_insertion | frameshift_variant | 13 | B101,B104,B12,B135,B16,B28,B56,B63,B96,C77,C87,D5,D7 |
Chr6:24427946 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | stop_gained | 3 | B112,B132,C1 |
Chr6:24427946 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | B112,B132,C1 |
Chr6:24427952 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | stop_gained | 5 | A21,B104,B28,C87,D5 |
Chr6:24427952 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 5 | A21,B104,B28,C87,D5 |
Chr6:24427980 |
G |
GT |
1bp_insertion | frameshift_variant | 30 | A16,B103,B106,B20,B23,B24,B28,B29,B47,B57,B63,B71,B74,B95,B97,C1,C13,C16,C19,C26,C30,C40,C51,C6,C64,C66,C7,C72,C83,D6 |
Chr6:24427984 |
AG |
A |
1bp_deletion | frameshift_variant | 30 | A16,B103,B106,B20,B23,B24,B28,B29,B47,B57,B63,B71,B74,B95,B97,C1,C13,C16,C19,C26,C30,C40,C51,C6,C64,C66,C7,C72,C83,D6 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。