当前解析结果
SmilChr01G000829| 统一新 Gene ID | SmilChr01G000829 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr01G000829 |
| 描述 | gamma-hordein-3-like |
| 染色体 / SeqID | Chr01 / NC_080387.1 |
| 坐标与链方向 | 17840038 - 17840523 / + |
| NCBI Gene ID | LOC130990676 |
|---|---|
| GeneID | 130990676 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC130990676 |
| 原始查询 | LOC130990676 |
| 来源 | GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | gamma-hordein-3-like |
| 产物 | gamma-hordein-3-like |
| Arabidopsis | -- |
| Rice | -- |
| GO | - |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:130990676 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Cytoplasm | 细胞质 | 1.00000 | XP_057770905.1 |
| 2 | Nucleus | 细胞核 | 0.60000 | XP_057770905.1 |
| 3 | Cytoplasmic granule | 细胞质颗粒 | 0.40000 | XP_057770905.1 |
| 4 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057770905.1 |
| 5 | Centromere | 着丝粒 | 0.00000 | XP_057770905.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr1:17840042 |
GC |
G |
1bp_deletion | frameshift_variant | 5 | B53,B71,C44,C67,C7 |
Chr1:17840042 |
GC |
G |
1bp_deletion | CDS_variant | 5 | B53,B71,C44,C67,C7 |
Chr1:17840070 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | B108,C36,C9 |
Chr1:17840071 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | stop_gained | 4 | A14,B34,B78,C16 |
Chr1:17840071 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | A14,B34,B78,C16 |
Chr1:17840077 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | B139,B62,C18 |
Chr1:17840088 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 5 | A5,B131,B83,C59,C78 |
Chr1:17840098 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 5 | A15,B102,C24,C35,C82 |
Chr1:17840109 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B93 |
Chr1:17840118 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B24 |
Chr1:17840122 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | C76 |
Chr1:17840124 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | C30,C36 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。