当前解析结果
SmilChr06G001998| 统一新 Gene ID | SmilChr06G001998 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr06G001998 |
| 描述 | uncharacterized SmilChr06G001998 |
| 染色体 / SeqID | Chr06 / NC_080392.1 |
| 坐标与链方向 | 25511895 - 25512488 / - |
| NCBI Gene ID | LOC130990680 |
|---|---|
| GeneID | 130990680 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC130990680 |
| 原始查询 | LOC130990680 |
| 来源 | GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | confidence=no_hit |
| 产物 | confidence=no_hit |
| Arabidopsis | -- |
| Rice | -- |
| GO | - |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:130990680 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Nucleus | 细胞核 | 1.00000 | XP_057770887.1 |
| 2 | Chromosome | 染色体 | 0.20000 | XP_057770887.1 |
| 3 | Nuclear body | 核内小体 | 0.20000 | XP_057770887.1 |
| 4 | Cytoplasm | 细胞质 | 0.20000 | XP_057770887.1 |
| 5 | Centromere | 着丝粒 | 0.00000 | XP_057770887.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr6:25511920 |
GC |
G |
1bp_deletion | frameshift_variant | 1 | C73 |
Chr6:25511920 |
GC |
G |
1bp_deletion | CDS_variant | 1 | C73 |
Chr6:25511939 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | stop_gained | 113 | A13,A15,A18,A22,A23,A25,A4,A6,A8,A9,B103,B106,B107,B11,B111,B113,B117,B118,B119,B121,B122,B123,B124,B125,B126,B127,B128,B129,B130,B131,B134,B135,B137,B14,B17,B18,B19,B21,B24,B31,B36,B40,B49,B5,B50,B54,B55,B59,B6,B61,B63,B67,B69,B70,B72,B73,B74,B76,B77,B79,B81,B83,B87,B88,B9,B90,B92,B93,B96,B97,B98,B99,C11,C14,C17,C19,C20,C23,C24,C25,C27,C28,C30,C34,C37,C38,C44,C47,C50,C54,C56,C57,C59,C60,C63,C67,C69,C71,C72,C74,C75,C76,C78,C83,C84,C87,D1,D10,D2,D5,D6,D8,D9 |
Chr6:25512165 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B12,B52 |
Chr6:25512185 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B23,D3 |
Chr6:25512205 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 5 | B87,C48,C61,C87,D10 |
Chr6:25512251 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | C73 |
Chr6:25512255 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B114 |
Chr6:25512290 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | B23,B87,C67 |
Chr6:25512322 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | D11 |
Chr6:25512324 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B123,D3 |
Chr6:25512337 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | C48 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。