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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr06G002006`

染色体: Chr06 坐标: 25752023-25752652 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr06G002006`
名称	SmilChr06G002006
描述	RNA polymerase II degradation factor 1-like
染色体 / SeqID	Chr06 / NC_080392.1
坐标与链方向	25752023 - 25752652 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130990683`
GeneID	`130990683`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130990683`
原始查询	`LOC130990683`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog
描述	RNA polymerase II degradation factor 1-like
产物	RNA polymerase II degradation factor 1-like
Arabidopsis	`-` -
Rice	`-` -
GO	-
KEGG	-
Pfam	-
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130990683

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	0.80000	`XP_057770890.1`
2	Nucleus	细胞核	0.60000	`XP_057770890.1`
3	Cytoplasmic granule	细胞质颗粒	0.40000	`XP_057770890.1`
4	Cytoplasmic ribonucleoprotein granule	Cytoplasmic ribonucleoprotein granule	0.40000	`XP_057770890.1`
5	Nucleoplasm	核质	0.20000	`XP_057770890.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr6:25752045`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B112,B80,C1,D4
`Chr6:25752052`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B136,B57,C82,C83
`Chr6:25752062`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B60,C10,C79
`Chr6:25752075`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr6:25752080`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	10	A23,B104,B140,B26,C36,C40,C46,C82,D1,D10
`Chr6:25752086`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B120,B56,C47,C6
`Chr6:25752087`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B120,B2,B56,C47,C6
`Chr6:25752089`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	142	A1,A10,A15,A19,A22,A25,A3,A4,A5,A6,A9,B10,B102,B103,B106,B107,B108,B11,B113,B115,B117,B118,B123,B124,B125,B126,B128,B129,B130,B134,B135,B136,B138,B14,B17,B19,B2,B21,B22,B24,B25,B27,B30,B33,B36,B38,B39,B4,B40,B44,B45,B49,B5,B50,B51,B56,B59,B61,B62,B63,B64,B66,B67,B69,B70,B72,B74,B76,B77,B78,B81,B83,B85,B87,B9,B90,B91,B92,B93,B96,B97,B98,C12,C14,C16,C17,C18,C19,C20,C23,C24,C25,C26,C27,C29,C30,C31,C32,C34,C35,C36,C37,C38,C4,C41,C42,C43,C44,C45,C47,C5,C50,C53,C55,C56,C57,C59,C6,C62,C63,C64,C65,C66,C68,C70,C71,C72,C73,C74,C75,C77,C78,C79,C8,C87,D1,D10,D11,D3,D4,D6,D9
`Chr6:25752091`	`GC`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	127	A10,A11,A14,A15,A19,A20,A22,A23,A4,A5,A6,B10,B100,B102,B103,B109,B111,B113,B114,B115,B12,B120,B121,B122,B123,B124,B125,B13,B130,B131,B132,B133,B134,B135,B136,B14,B140,B15,B17,B18,B19,B2,B20,B23,B27,B32,B33,B34,B36,B37,B39,B4,B40,B41,B44,B48,B49,B51,B52,B53,B55,B58,B6,B62,B63,B64,B67,B69,B7,B70,B73,B74,B76,B77,B78,B80,B84,B87,B9,B96,B99,C11,C12,C14,C17,C19,C21,C22,C23,C27,C28,C30,C32,C33,C34,C36,C37,C38,C40,C41,C44,C49,C51,C54,C56,C61,C62,C63,C64,C66,C67,C69,C7,C70,C73,C75,C76,C80,C83,C84,C86,D2,D5,D6,D7,D8,D9
`Chr6:25752104`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	84	A10,A13,A16,A18,A20,A21,A23,A3,B1,B104,B105,B108,B11,B110,B111,B112,B124,B137,B17,B20,B25,B27,B29,B31,B33,B34,B35,B36,B4,B43,B45,B48,B50,B51,B52,B54,B56,B59,B6,B61,B62,B65,B66,B7,B72,B74,B75,B79,B81,B83,B86,B88,B94,B98,B99,C13,C14,C15,C2,C29,C3,C37,C44,C45,C46,C48,C50,C53,C54,C58,C59,C60,C61,C62,C64,C70,C77,C79,C81,C9,D1,D10,D11,D3
`Chr6:25752111`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B64,B88,C29,C4,C63
`Chr6:25752119`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	11	B112,B132,B56,B62,B75,B80,C1,C44,C62,C64,D4

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

当前发布数据中，此基因没有可展示的 Pfam 结构域命中。

进入结构域查询

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057914907.1
ATGGGCTATCAAAGTAAACAACCGTTTTACCCACCACAACCGCAATATCCTCCTCAGCAGTACCGGCAGCAATACCCGCAGCAGTACTCTATGCCGCAAGGAAACTTTCAGCCGCAACACTTCCAGAATGCGCAGCAGATGCCACCGTCGAAACCGTCGCTGGAGGAGACTTTGCAGTCTTTCGTGGAGGTCAGCAAGCAGAACATGGAGGTGACCAAGCAGAATATGGAATCTCAGTCCGCAACCATAAAAAGACTTGA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130990683
ATGGGCTATCAAAGTAAACAACCGTTTTACCCACCACAACCGCAATATCCTCCTCAGCAGTACCGGCAGCAATACCCGCAGCAGTACTCTATGCCGCAAGGAAACTTTCAGCCGCAACACTTCCAGAATGCGCAGCAGATGCCACCGTCGAAACCGTCGCTGGAGGAGACTTTGCAGTCTTTCGTGGAGGTCAGCAAGCAGAACATGGAGGTGACCAAGCAGAATATGGAATCTCAGTCCGCAACCATAAAAAGACTTGA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057770890.1
MGYQSKQPFYPPQPQYPPQQYRQQYPQQYSMPQGNFQPQHFQNAQQMPPSKPSLEETLQSFVEVSKQNMEVTKQNMESQSATIKRLETTVGQLSGTLNLLQQQQQLEKLYGQPLQTHQAQAIIVLRSGKMVDNKVNVPEQTTVPEQTWMLELIKAPEKTIPEQMWMPETRVPEQMKVPEQTRVPEQTWTPEQTRVLEQMKVPEQTRVPE

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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