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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr06G002013`

染色体: Chr06 坐标: 25836285-25838065 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr06G002013`
名称	SmilChr06G002013
描述	uncharacterized SmilChr06G002013
染色体 / SeqID	Chr06 / NC_080392.1
坐标与链方向	25836285 - 25838065 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130990685`
GeneID	`130990685`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130990685`
原始查询	`LOC130990685`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	Ribonuclease H-like superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:829030]; symbol=AT4G29090; hit=AT4G29090; species=arabidopsis; confidence=low
产物	Ribonuclease H-like superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:829030]; symbol=AT4G29090; hit=AT4G29090; species=arabidopsis; confidence=low
Arabidopsis	`AT4G29090` (AT4G29090) Ribonuclease H-like superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:829030] identity=34.4; qcov=0.351; evalue=3.85e-27; confidence=low
Rice	`Os12g0407750` - identity=48.6; qcov=0.162; evalue=5.44e-18; confidence=weak
GO	GO:0003676 (nucleic acid binding); GO:0004523 (RNA-DNA hybrid ribonuclease activity)
KEGG	-
Pfam	PF13456 (RVT_3)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130990685

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytosol	细胞质基质	0.80000	`XP_057770893.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.60000	`XP_057770893.1`
3	Nucleus	细胞核	0.40000	`XP_057770893.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057770893.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057770893.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr6:25836333`	`CG`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	7	B117,B25,C27,C31,C56,C65,C70
`Chr6:25836373`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr6:25836376`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C74
`Chr6:25836437`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B12
`Chr6:25836447`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A3,B66,B98,C38,C43
`Chr6:25836510`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B136,B57,C82,C83
`Chr6:25836530`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	1	B52
`Chr6:25836530`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B52
`Chr6:25836551`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B108
`Chr6:25836557`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	1	A14
`Chr6:25836557`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A14
`Chr6:25836590`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A20,B1,B13,B51

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057770893.1

456 aa

228

456

RVT_3

PF13456 RVT_3 306-428 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057770893.1`	Pfam	`PF13456`	RVT_3	Domain	306	428	7e-17	62.2	Reverse transcriptase-like

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057914910.1
ATGTGGCAAAGGCTTCAAGGGTGGAATGACGAACGGCTCTCTAAAGCGGGTAAGGAGGTCCTTATTAAAGGAATAGCTCAGGCTATTCCTTCTTATTGCATGGCTATCTTTTCTTTGTCTGTTGGTTTAACGAATGATTTGGAACGGATGTTAAACTCTTTTTGGTTGGGGAATAAAGGCTCGGATGGAAAAAGTATTAATTGGCTGAAATGGGAAAGATTGTGTGTTGATAAGAAGCTCAGTGACTTAGGTTTTCGAAG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130990685
ATGTGGCAAAGGCTTCAAGGGTGGAATGACGAACGGCTCTCTAAAGCGGGTAAGGAGGTCCTTATTAAAGGAATAGCTCAGGCTATTCCTTCTTATTGCATGGCTATCTTTTCTTTGTCTGTTGGTTTAACGAATGATTTGGAACGGATGTTAAACTCTTTTTGGTTGGGGAATAAAGGCTCGGATGGAAAAAGTATTAATTGGCTGAAATGGGAAAGATTGTGTGTTGATAAGAAGCTCAGTGACTTAGGTTTTCGAAG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057770893.1
MWQRLQGWNDERLSKAGKEVLIKGIAQAIPSYCMAIFSLSVGLTNDLERMLNSFWLGNKGSDGKSINWLKWERLCVDKKLSDLGFRSLQLLNVAMLGKMGWRLIDEPTALVCQVLRAKYFRNGDFLSAKIGRSPSFTWRSICSGQDLIRQGTRWRIGDGSSIWVFKDPWLRSREPFKVSAQLCPPELADITIKEVDMASLKQRTLFGEDWRVARNNLPSKDRLLARGIAVAGEGLYVDVAAVWKDRNGAVWNNCLPIPAH...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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