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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr06G002133`

染色体: Chr06 坐标: 28726910-28727947 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr06G002133`
名称	SmilChr06G002133
描述	uncharacterized SmilChr06G002133
染色体 / SeqID	Chr06 / NC_080392.1
坐标与链方向	28726910 - 28727947 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130990724`
GeneID	`130990724`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130990724`
原始查询	`LOC130990724`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os08g0315200; species=rice; confidence=low
产物	hit=Os08g0315200; species=rice; confidence=low
Arabidopsis	`-` -
Rice	`Os08g0315200` - identity=28.9; qcov=0.535; evalue=1.84e-14; confidence=low
GO	GO:0003676 (nucleic acid binding); GO:0008270 (zinc ion binding)
KEGG	-
Pfam	PF00098 (zf-CCHC)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130990724

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057770937.1`
2	Nucleus	细胞核	0.80000	`XP_057770937.1`
3	Cytosol	细胞质基质	0.60000	`XP_057770937.1`
4	Nucleoplasm	核质	0.20000	`XP_057770937.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057770937.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr6:28726921`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	6	A22,B129,B2,C23,C3,C79
`Chr6:28726924`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B118,B77
`Chr6:28726927`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A4,B22
`Chr6:28726930`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	7	B1,B17,B19,B53,B94,C10,C14
`Chr6:28726934`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B69,C48,C64,C66
`Chr6:28726936`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	2	B65,C49
`Chr6:28726936`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B65,C49
`Chr6:28726939`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr6:28726945`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	3	B122,B123,B131
`Chr6:28726945`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B122,B123,B131
`Chr6:28726948`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	25	A11,B102,B12,B124,B130,B55,B58,B67,B70,B81,B82,C16,C22,C4,C48,C5,C60,C72,C78,C79,C84,D11,D2,D3,D8
`Chr6:28726951`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B63,B83,C46,D4

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057770937.1

310 aa

155

310

zf-CCHC

PF00098 zf-CCHC 254-270 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057770937.1`	Pfam	`PF00098`	zf-CCHC	Domain	254	270	0.00012	22.7	Zinc knuckle

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057914954.1
ATGCCTCCGAGACGCAACCAAGGGCGTAATTTAGATGACAGGCGGGAAGATACTCCCCCACCACCGCCGCAACCTGAGATGAGAATCGAAGAACGTTTTCTTCGACATAATCCACCCGGATTTAGTGGGACTGGAAATCTACAAGAGGCGGAAGACTGGGCACGTCAGAAGACTCTGACACCCGAGCAAATAGAGAACTACACCTGGGAACAATTCAAGGCTACCCTTTTTGAGAAGTATATACCGAGGAGTTACCGTAA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130990724
ATGCCTCCGAGACGCAACCAAGGGCGTAATTTAGATGACAGGCGGGAAGATACTCCCCCACCACCGCCGCAACCTGAGATGAGAATCGAAGAACGTTTTCTTCGACATAATCCACCCGGATTTAGTGGGACTGGAAATCTACAAGAGGCGGAAGACTGGGCACGTCAGAAGACTCTGACACCCGAGCAAATAGAGAACTACACCTGGGAACAATTCAAGGCTACCCTTTTTGAGAAGTATATACCGAGGAGTTACCGTAA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057770937.1
MPPRRNQGRNLDDRREDTPPPPPQPEMRIEERFLRHNPPGFSGTGNLQEAEDWARQKTLTPEQIENYTWEQFKATLFEKYIPRSYRKQREAEFGSLRQGKKSVAEYDREFCDLSRFAPQKVDTDEKMSELFCAGLRQDIRVVLASQAALPYTEALNRALDMELAMHPEKVLQAPALPLTQTKMPGGQQTAPPAQSGKRKWEDRGQGNRKPWQGQGQQQQGKQQYPGQSSGQPRTPPCAKCNKMHLGVCKAGSNSCYNCGQ...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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