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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr06G002146`

染色体: Chr06 坐标: 29162192-29163166 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr06G002146`
名称	SmilChr06G002146
描述	uncharacterized SmilChr06G002146
染色体 / SeqID	Chr06 / NC_080392.1
坐标与链方向	29162192 - 29163166 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130990729`
GeneID	`130990729`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130990729`
原始查询	`LOC130990729`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os12g0156200; species=rice; confidence=low
产物	hit=Os12g0156200; species=rice; confidence=low
Arabidopsis	`AT2G01050` (AT2G01050) zinc ion binding / nucleic acid binding protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:814629] identity=26.4; qcov=0.738; evalue=9.57e-15; confidence=low
Rice	`Os12g0156200` - identity=30.7; qcov=0.543; evalue=3.81e-20; confidence=low
GO	GO:0003676 (nucleic acid binding); GO:0008270 (zinc ion binding)
KEGG	-
Pfam	PF14111 (DUF4283); PF14392 (zf-CCHC_4)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130990729

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytosol	细胞质基质	0.80000	`XP_057770941.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.60000	`XP_057770941.1`
3	Endoplasmic reticulum	内质网	0.20000	`XP_057770941.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057770941.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057770941.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr6:29162216`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr6:29162286`	`T`	`TC`	1bp_insertion	frameshift_variant	2	C82,D9
`Chr6:29162286`	`T`	`TC`	1bp_insertion	CDS_variant	2	C82,D9
`Chr6:29162289`	`TC`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	2	C82,D9
`Chr6:29162289`	`TC`	`T`	1bp_deletion	CDS_variant	2	C82,D9
`Chr6:29162300`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C82,D9
`Chr6:29162307`	`C`	`CCA`	2bp_insertion	frameshift_variant	3	C71,C82,D9
`Chr6:29162307`	`C`	`CCA`	2bp_insertion	CDS_variant	3	C71,C82,D9
`Chr6:29162310`	`AAG`	`A`	2bp_deletion	frameshift_variant	3	C71,C82,D9
`Chr6:29162310`	`AAG`	`A`	2bp_deletion	CDS_variant	3	C71,C82,D9
`Chr6:29162336`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B14,C14,C71,C82,D9
`Chr6:29162367`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A19

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057770941.1

324 aa

162

324

DUF4283

zf-CCHC_4

PF14111 DUF4283 36-117 aa PF14392 zf-CCHC_4 200-225 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057770941.1`	Pfam	`PF14111`	DUF4283	Domain	36	117	3.6e-12	46.5	Domain of unknown function (DUF4283)
`XP_057770941.1`	Pfam	`PF14392`	zf-CCHC_4	Domain	200	225	5.3e-07	29.9	Zinc knuckle

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057914958.1
ATGGATCAAGAGGAGATAAGGCGACTCGTGGATAAATTGAAGTTGGAGGAGGAAGCGGACGAGAGTACGGTGAATCTATCACAACACTTGTCAGAAAGTTTACGACAAAAAACAAAACTTTGTTTGGTGGGGAAAGTTTTTGCGGGACATCAAATCAATCGGGAGTTGCTGGCGAATCACTTACCAAGTATTCTCCAGGCGCAACAACGTGTGGATATTGAGATCGTGGGAGCGAATCTTTTTGTTGCCCTATTTGCTTC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130990729
ATGGATCAAGAGGAGATAAGGCGACTCGTGGATAAATTGAAGTTGGAGGAGGAAGCGGACGAGAGTACGGTGAATCTATCACAACACTTGTCAGAAAGTTTACGACAAAAAACAAAACTTTGTTTGGTGGGGAAAGTTTTTGCGGGACATCAAATCAATCGGGAGTTGCTGGCGAATCACTTACCAAGTATTCTCCAGGCGCAACAACGTGTGGATATTGAGATCGTGGGAGCGAATCTTTTTGTTGCCCTATTTGCTTC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057770941.1
MDQEEIRRLVDKLKLEEEADESTVNLSQHLSESLRQKTKLCLVGKVFAGHQINRELLANHLPSILQAQQRVDIEIVGANLFVALFASTMDRKHVLLGGPWHLFQDLMLFKKLEGFQNPTDVRFDEFTGWVQCHNMPIACMHPDVVRRIGEQIGVVEEIDMGVGGLCMGRFARVRVRWRMDNPLKRCVRLLPDGEMEGAIVLLLYEKLPNFCFACGKIGHLVRFCEDKKVDKGGEFKFGVWLMAAKVQETRRKSTMGTMPR...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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