当前解析结果
SmilChr06G002148| 统一新 Gene ID | SmilChr06G002148 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr06G002148 |
| 描述 | uncharacterized SmilChr06G002148 |
| 染色体 / SeqID | Chr06 / NC_080392.1 |
| 坐标与链方向 | 29196834 - 29199584 / - |
| NCBI Gene ID | LOC130990731 |
|---|---|
| GeneID | 130990731 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC130990731 |
| 原始查询 | LOC130990731 |
| 来源 | GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | confidence=no_hit |
| 产物 | confidence=no_hit |
| Arabidopsis | -- |
| Rice | -- |
| GO | - |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:130990731 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Nucleus | 细胞核 | 1.00000 | XP_057770943.1 |
| 2 | Chromosome | 染色体 | 0.20000 | XP_057770943.1 |
| 3 | Centromere | 着丝粒 | 0.00000 | XP_057770943.1 |
| 4 | Chromatin | 染色质 | 0.00000 | XP_057770943.1 |
| 5 | Telomere | 端粒 | 0.00000 | XP_057770943.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr6:29196939 |
ATT |
A |
2bp_deletion | frameshift_variant | 8 | A10,A20,B128,B35,B79,B88,C35,C4 |
Chr6:29196947 |
CG |
C |
1bp_deletion | frameshift_variant | 2 | C33,D7 |
Chr6:29196947 |
CG |
C |
1bp_deletion | CDS_variant | 2 | C33,D7 |
Chr6:29196972 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B90,B92 |
Chr6:29196985 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | C33,D7 |
Chr6:29196989 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B88 |
Chr6:29196997 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | A21,C36,C82 |
Chr6:29197011 |
A |
AT |
1bp_insertion | frameshift_variant | 25 | A21,A7,B10,B108,B11,B13,B138,B32,B4,B42,B43,B47,B51,B58,B60,B75,C13,C45,C5,C72,C75,C76,C83,D10,D7 |
Chr6:29197030 |
AG |
A |
1bp_deletion | frameshift_variant | 6 | B125,B82,B90,B92,C39,D3 |
Chr6:29197046 |
TCA |
T |
2bp_deletion | frameshift_variant | 2 | C32,C68 |
Chr6:29197046 |
TCA |
T |
2bp_deletion | CDS_variant | 2 | C32,C68 |
Chr6:29197053 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | D6 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。