Gene Card 基因详情

支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr06G002157`

染色体: Chr06 坐标: 29397279-29399027 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr06G002157`
名称	SmilChr06G002157
描述	uncharacterized SmilChr06G002157
染色体 / SeqID	Chr06 / NC_080392.1
坐标与链方向	29397279 - 29399027 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130990736`
GeneID	`130990736`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130990736`
原始查询	`LOC130990736`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os12g0597300; species=rice; confidence=low
产物	hit=Os12g0597300; species=rice; confidence=low
Arabidopsis	`AT1G06740` (MUG3) MuDR family transposase [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:3766669] identity=23.7; qcov=0.891; evalue=4.69e-14; confidence=weak
Rice	`Os12g0597300` - identity=27.5; qcov=1.02; evalue=7.27e-26; confidence=low
GO	-
KEGG	-
Pfam	-
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130990736

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057770948.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.20000	`XP_057770948.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057770948.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057770948.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057770948.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr6:29397294`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B115,B16,B58
`Chr6:29397351`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr6:29397437`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B78,C70,D8
`Chr6:29397458`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	2	B78,C48
`Chr6:29397458`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B78,C48
`Chr6:29397491`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C66,C68
`Chr6:29397828`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B101,C2,C32,C68
`Chr6:29397852`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C60
`Chr6:29397857`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C60
`Chr6:29397858`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C60
`Chr6:29397877`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C60
`Chr6:29397893`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B63,C77,C8

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

当前发布数据中，此基因没有可展示的 Pfam 结构域命中。

进入结构域查询

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057914965.1
ATGAAGCAAGGGGCTGAGGCAAAAGTTGTACGCTCAGATCAGGGACACCTCTATTACAAGTGCAAGCACTCTGATAAGTGCAAGTTCGATAACAAAATTAAGGGCTACGGGCAAGCTGTTGTTGAGCTTTTCCGCCAGGCTGCATACGCCTACACGGACTCAGAATTTTCACGTGCAACGTCGGCTATGGCTCAATTGAAGCCGGCGGCGTACGGGAAGTTGATGCGCGTAGGCCCTGAGAAGTGGGCACGATCACAAAG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130990736
ATGAAGCAAGGGGCTGAGGCAAAAGTTGTACGCTCAGATCAGGGACACCTCTATTACAAGTGCAAGCACTCTGATAAGTGCAAGTTCGATAACAAAATTAAGGGCTACGGGCAAGCTGTTGTTGAGCTTTTCCGCCAGGCTGCATACGCCTACACGGACTCAGAATTTTCACGTGCAACGTCGGCTATGGCTCAATTGAAGCCGGCGGCGTACGGGAAGTTGATGCGCGTAGGCCCTGAGAAGTGGGCACGATCACAAAG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057770948.1
MKQGAEAKVVRSDQGHLYYKCKHSDKCKFDNKIKGYGQAVVELFRQAAYAYTDSEFSRATSAMAQLKPAAYGKLMRVGPEKWARSQSPVTHYSFLTSNAAEALNARLLWARRLPICSMLEAIRMVLEQWFNDRLASAEESDDLLTPEATQKISAEISKSRRYTAKRTSERKYRVCAGDRRFMVDLQAKGCECNEFDLDGMPAAKEPVEDYVEAYYLRSSLVQTYSGPVNHLPLLEHWEIPFEVATDIVLPNLSRRQAGRP...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

JBrowse

跳转到基因组浏览器