当前解析结果
SmilChr01G000835| 统一新 Gene ID | SmilChr01G000835 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr01G000835 |
| 描述 | vegetative cell wall protein gp1-like |
| 染色体 / SeqID | Chr01 / NC_080387.1 |
| 坐标与链方向 | 18033341 - 18034810 / + |
| NCBI Gene ID | LOC130990737 |
|---|---|
| GeneID | 130990737 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC130990737 |
| 原始查询 | LOC130990737 |
| 来源 | GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | vegetative cell wall protein gp1-like |
| 产物 | vegetative cell wall protein gp1-like |
| Arabidopsis | -- |
| Rice | -- |
| GO | - |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:130990737 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Cytoplasm | 细胞质 | 0.40000 | XP_057770970.1 |
| 2 | Nucleus | 细胞核 | 0.20000 | XP_057770970.1 |
| 3 | Acrosome | Acrosome | 0.20000 | XP_057770970.1 |
| 4 | Mitochondrion | 线粒体 | 0.20000 | XP_057770970.1 |
| 5 | Cell projection | 细胞突起 | 0.20000 | XP_057770970.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr1:18034421 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B94 |
Chr1:18034471 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | A5 |
Chr1:18034491 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | C14 |
Chr1:18034494 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | A9,B113,B95,C61 |
Chr1:18034551 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | C52 |
Chr1:18034621 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | C21,C54,D3 |
Chr1:18034648 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B100,B94 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。