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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr06G002179`

染色体: Chr06 坐标: 30040220-30041879 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr06G002179`
名称	SmilChr06G002179
描述	uncharacterized SmilChr06G002179
染色体 / SeqID	Chr06 / NC_080392.1
坐标与链方向	30040220 - 30041879 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130990741`
GeneID	`130990741`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130990741`
原始查询	`LOC130990741`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os08g0208400; species=rice; confidence=medium
产物	hit=Os08g0208400; species=rice; confidence=medium
Arabidopsis	`-` -
Rice	`Os08g0208400` - identity=37.9; qcov=1.05; evalue=6.33e-119; confidence=medium
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF02992 (Transposase_21); PF13963 (Transpos_assoc)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130990741

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057770953.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057770953.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057770953.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057770953.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057770953.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr6:30040223`	`G`	`GT`	1bp_insertion	frameshift_variant	18	A16,B126,B129,B48,B49,B54,B57,B61,B84,B90,B91,C27,C29,C31,C70,C71,C85,D4
`Chr6:30040240`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B17,C4,C75
`Chr6:30040256`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C49
`Chr6:30040279`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C80
`Chr6:30040281`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr6:30040285`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B112,B63,B65,C12,C34
`Chr6:30040295`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B37,B71,B89,C62,C9
`Chr6:30040297`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B105,B22,C6
`Chr6:30040376`	`A`	`AT`	1bp_insertion	frameshift_variant	1	C42
`Chr6:30040376`	`A`	`AT`	1bp_insertion	CDS_variant	1	C42
`Chr6:30040395`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C60
`Chr6:30040439`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B13

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057770953.1

532 aa

266

532

Transpos_assoc

Transposase_21

PF13963 Transpos_assoc 3-75 aa PF02992 Transposase_21 270-481 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057770953.1`	Pfam	`PF13963`	Transpos_assoc	Domain	3	75	1.2e-20	74.2	Transposase-associated domain
`XP_057770953.1`	Pfam	`PF02992`	Transposase_21	Family	270	481	1.4e-95	319.2	Transposase family tnp2

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057914970.1
ATGGATAAAGATTGGATGTCCAAAAATAGATTATCGGACGAGTACGAAATTGGAGTGGAGTCTTTCTTGCAGTTTGCCGTTAAAAATGGAAAAGATCCCAATGCTATGCCTTGTCCTTGTGTAAAGTGTGGCAATCTACGTGATAAGGATGTGAAAACCATAAGAGCTCATCTCACGTATAATGGAATGGATTTAACATACGTTAGTTGGATCTTCCATGGGGAGAGAACTAGGCCTAACACAAGCAATAAAGAAGAAGA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130990741
ATGGATAAAGATTGGATGTCCAAAAATAGATTATCGGACGAGTACGAAATTGGAGTGGAGTCTTTCTTGCAGTTTGCCGTTAAAAATGGAAAAGATCCCAATGCTATGCCTTGTCCTTGTGTAAAGTGTGGCAATCTACGTGATAAGGATGTGAAAACCATAAGAGCTCATCTCACGTATAATGGAATGGATTTAACATACGTTAGTTGGATCTTCCATGGGGAGAGAACTAGGCCTAACACAAGCAATAAAGAAGAAGA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057770953.1
MDKDWMSKNRLSDEYEIGVESFLQFAVKNGKDPNAMPCPCVKCGNLRDKDVKTIRAHLTYNGMDLTYVSWIFHGERTRPNTSNKEEESTAGHDFCSDEPIDMVHDAYVDNPTHFHRLLEEAEMPLYLGCDQFTKLSATVKLYNLKAKYGWSDTSFTDLLVLIREMLPKDNVLPASLYEAKKSLSTLGMKYEKIHACPEDCILYRHQHANLVNCPTCGKSRWKVLKNDKINEGVPAKVLWYFPPIPRFQRMFGNKEMSKNL...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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