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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr06G002186`

染色体: Chr06 坐标: 30221613-30229095 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr06G002186`
名称	SmilChr06G002186
描述	uncharacterized SmilChr06G002186
染色体 / SeqID	Chr06 / NC_080392.1
坐标与链方向	30221613 - 30229095 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130990743`
GeneID	`130990743`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130990743`
原始查询	`LOC130990743`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	confidence=no_hit
产物	confidence=no_hit
Arabidopsis	`-` -
Rice	`-` -
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF13650 (Asp_protease_2)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130990743

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057770956.1`
2	Nucleus	细胞核	0.60000	`XP_057770956.1`
3	Cytoplasmic granule	细胞质颗粒	0.60000	`XP_057770956.1`
4	Cytosol	细胞质基质	0.60000	`XP_057770956.1`
5	Cytoplasmic ribonucleoprotein granule	Cytoplasmic ribonucleoprotein granule	0.40000	`XP_057770956.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr6:30228190`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	C26,C59,C75
`Chr6:30228217`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B107,B63,C79
`Chr6:30228227`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B3
`Chr6:30228232`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B3
`Chr6:30228511`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	9	A19,B113,B33,B55,B76,C30,C54,C56,C57
`Chr6:30228514`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	60	A10,A11,A14,A20,A4,A5,A9,B102,B103,B110,B121,B124,B126,B129,B130,B131,B15,B16,B18,B22,B24,B26,B3,B30,B4,B40,B41,B46,B51,B53,B57,B62,B68,B72,B73,B78,B84,B85,B86,B98,C15,C16,C2,C23,C32,C36,C40,C45,C46,C53,C57,C64,C70,C72,C76,C78,C84,C85,C86,D10
`Chr6:30228537`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C55
`Chr6:30228538`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	2	B54,B86
`Chr6:30228538`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B54,B86
`Chr6:30228542`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	9	A23,A9,B104,B128,B136,B45,B64,C5,C50
`Chr6:30228548`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B10,C76
`Chr6:30228560`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B59,B81,C49

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057770956.1

918 aa

459

918

Asp_protease_2

PF13650 Asp_protease_2 489-585 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057770956.1`	Pfam	`PF13650`	Asp_protease_2	Domain	489	585	3.9e-06	28.2	Aspartyl protease

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057914973.1
CAACCTTGGGAGCAATCTGCGAAGACGGACCACGGCGCCGCCGTGTCACGGCGGCCGCCGTCCACGGCGCCGCCGTCTCACGGCGGCCGCCGTCCAGACGCCGGCCGCGGCCCCACGGCGCGGGCCGTACAATTTTTGGAGGAAACCGCGAAGGGGCATCACGGCGGCGCCGACCCACGGCGGCCGCCGTCCACGGCGCCGCCGTCTCACGGCGGCCGCCGCCCCTGTGCAGATCTGGCAGTTACGGAAATTGCTATAAA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130990743
ATGGCGGAGCAGAATGTCCAGTACATGGGAGATTTTTCCAGGCCAGTTATTGGGACCACTAGCACTTCTGCGATAGTGTTTCCCACGGCGGTCCGGAATTATAATCTGAAGCCCAACGACTCAAACCTGCTGCCGCTCTTTCACGGGATGCCCAGTGAGGACGCCTTGCAGTTCATCCGTGATTTCTGCACCCAAGTGCAGACCTTCCCACTGCTGGAGCTCACCGAGGATCAGTTGAGACTCAAGTGCTTACCTTATGC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057770956.1
MAEQNVQYMGDFSRPVIGTTSTSAIVFPTAVRNYNLKPNDSNLLPLFHGMPSEDALQFIRDFCTQVQTFPLLELTEDQLRLKCLPYALKDRARTWLLSLPPNSITTWGEASEKFMLKYYPNHKTQEIRSQIMNFMQGADEPFHEAWERFQELLRQCPQHQLPPVMLMQFFYDGLIQTAQFMVDSTAGGNIARKTADELKEIFNTLAASSQQKSARGRRFEANAVAPNNELQKQVAELMRQVQHLKMNQAEAPPVHAPPAE...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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