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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr06G002192`

染色体: Chr06 坐标: 30378961-30390403 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr06G002192`
名称	SmilChr06G002192
描述	uncharacterized SmilChr06G002192
染色体 / SeqID	Chr06 / NC_080392.1
坐标与链方向	30378961 - 30390403 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130990744`
GeneID	`130990744`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130990744`
原始查询	`LOC130990744`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	NifS; symbol=NifS; hit=Os11g0209900; species=rice; confidence=high
产物	NifS; symbol=NifS; hit=Os11g0209900; species=rice; confidence=high
Arabidopsis	`-` -
Rice	`Os11g0209900` (NifS) - identity=50.3; qcov=1.01; evalue=0; confidence=high
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF00266 (Aminotran_5)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130990744

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	0.80000	`XP_057770957.1`
2	Cytosol	细胞质基质	0.40000	`XP_057770957.1`
3	Nucleus	细胞核	0.20000	`XP_057770957.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057770957.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057770957.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr6:30379037`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C45
`Chr6:30379242`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C86
`Chr6:30383130`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B140
`Chr6:30383217`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C36
`Chr6:30383364`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C86
`Chr6:30388655`	`AC`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	7	B135,B63,B83,B96,C19,C59,C77
`Chr6:30388796`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B19,C10
`Chr6:30389352`	`A`	`ATT`	2bp_insertion	frameshift_variant	2	A18,B62
`Chr6:30389352`	`A`	`ATT`	2bp_insertion	CDS_variant	2	A18,B62
`Chr6:30389505`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B140,C24
`Chr6:30389507`	`AC`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B103
`Chr6:30389507`	`AC`	`A`	1bp_deletion	CDS_variant	1	B103

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057770957.1

609 aa

304

609

Aminotran_5

PF00266 Aminotran_5 86-510 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057770957.1`	Pfam	`PF00266`	Aminotran_5	Domain	86	510	1.7e-37	130.0	Aminotransferase class-V

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057914974.1
ATGACCATGCAGATGAAATTTGAATGGCATCATCATGATGCTCCAAGTTACGGAGTTGATCAAGATCTCAACGATGATGTTGCCCATCATCATTATCATGATAAAGTCAACCATGAGATTCAGCCATTTCATATTATTGGTAGAGGCGTGCCAAAAAGCAACGACTCCACTGCAAGGAAACTCAGGTGGTTGCGCTCTCAAATCATCGGCGGCTCAGCTGAACTCAAAACTCCCTTTGGGCGGCGCCGCCTCACTTACGC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130990744
ATGACCATGCAGATGAAATTTGAATGGCATCATCATGATGCTCCAAGTTACGGAGTTGATCAAGATCTCAACGATGATGTTGCCCATCATCATTATCATGATAAAGTCAACCATGAGATTCAGCCATTTCATATTATTGGTAGAGGCGTGCCAAAAAGCAACGACTCCACTGCAAGGAAACTCAGGTGGTTGCGCTCTCAAATCATCGGCGGCTCAGCTGAACTCAAAACTCCCTTTGGGCGGCGCCGCCTCACTTACGC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057770957.1
MTMQMKFEWHHHDAPSYGVDQDLNDDVAHHHYHDKVNHEIQPFHIIGRGVPKSNDSTARKLRWLRSQIIGGSAELKTPFGRRRLTYADHTASGRSLHYIENYITTKLLPFYGNTHTSDSHVGYHTTTMVHEATNYVKRCLGGGEEDSIIYCGSGSTAAIKRLQEVMGIVVPSILRERVLKCLSKEERWVVLVGPYEHHSNLLSWRQSLAEVVEIGLDHRGHIDMEALREKLSFYMNEKRKILGSFSACSNVTGIITDTRA...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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