当前解析结果
SmilChr06G002197| 统一新 Gene ID | SmilChr06G002197 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr06G002197 |
| 描述 | uncharacterized SmilChr06G002197 |
| 染色体 / SeqID | Chr06 / NC_080392.1 |
| 坐标与链方向 | 30520143 - 30520736 / - |
| NCBI Gene ID | LOC130990748 |
|---|---|
| GeneID | 130990748 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC130990748 |
| 原始查询 | LOC130990748 |
| 来源 | GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | hit=Os08g0315200; species=rice; confidence=low |
| 产物 | hit=Os08g0315200; species=rice; confidence=low |
| Arabidopsis | -- |
| Rice | Os08g0315200- identity=32.5; qcov=0.858; evalue=9.05e-17; confidence=low |
| GO | - |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:130990748 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Cytoplasm | 细胞质 | 0.80000 | XP_057770959.1 |
| 2 | Nucleus | 细胞核 | 0.60000 | XP_057770959.1 |
| 3 | Cytosol | 细胞质基质 | 0.40000 | XP_057770959.1 |
| 4 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057770959.1 |
| 5 | Centromere | 着丝粒 | 0.00000 | XP_057770959.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr6:30520148 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B64 |
Chr6:30520160 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | stop_gained | 18 | A10,A11,A18,A21,A24,A7,B102,B20,B35,B46,B53,B66,B94,C10,C33,C42,C58,C87 |
Chr6:30520164 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | C58 |
Chr6:30520172 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | B59,B79,C73 |
Chr6:30520187 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | stop_gained | 9 | B113,B19,B39,B45,B67,B85,B95,C64,D3 |
Chr6:30520192 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | B30,B45,B69,D4 |
Chr6:30520194 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | C66 |
Chr6:30520220 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | stop_gained | 5 | B130,B132,B55,B60,C4 |
Chr6:30520220 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 5 | B130,B132,B55,B60,C4 |
Chr6:30520229 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | C68 |
Chr6:30520246 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | A25,B138,C25 |
Chr6:30520247 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 5 | B26,B67,B72,C53,C87 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。