当前解析结果
SmilChr06G002208| 统一新 Gene ID | SmilChr06G002208 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr06G002208 |
| 描述 | uncharacterized SmilChr06G002208 |
| 染色体 / SeqID | Chr06 / NC_080392.1 |
| 坐标与链方向 | 30756286 - 30756879 / - |
| NCBI Gene ID | LOC130990752 |
|---|---|
| GeneID | 130990752 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC130990752 |
| 原始查询 | LOC130990752 |
| 来源 | GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | confidence=no_hit |
| 产物 | confidence=no_hit |
| Arabidopsis | -- |
| Rice | -- |
| GO | - |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:130990752 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Cytoplasm | 细胞质 | 0.80000 | XP_057770964.1 |
| 2 | Cytosol | 细胞质基质 | 0.80000 | XP_057770964.1 |
| 3 | Nucleus | 细胞核 | 0.00000 | XP_057770964.1 |
| 4 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057770964.1 |
| 5 | Centromere | 着丝粒 | 0.00000 | XP_057770964.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr6:30756303 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | stop_gained | 164 | A10,A13,A14,A15,A16,A18,A2,A20,A22,A24,A25,A3,A5,A6,B1,B10,B104,B105,B106,B107,B108,B11,B110,B111,B113,B114,B115,B118,B12,B120,B123,B124,B125,B126,B129,B13,B130,B131,B134,B135,B137,B138,B139,B14,B15,B16,B17,B19,B2,B21,B24,B25,B26,B27,B29,B3,B30,B33,B34,B38,B39,B4,B44,B46,B47,B49,B5,B50,B51,B52,B55,B56,B57,B59,B60,B61,B62,B63,B65,B67,B68,B69,B70,B72,B74,B77,B78,B80,B82,B83,B84,B86,B87,B88,B90,B91,B92,B93,B95,B97,B98,C12,C13,C14,C16,C17,C18,C19,C2,C20,C23,C24,C25,C26,C27,C29,C30,C31,C32,C35,C36,C38,C4,C40,C43,C44,C45,C46,C47,C49,C51,C53,C55,C56,C57,C59,C6,C60,C61,C62,C63,C64,C66,C68,C70,C71,C72,C73,C74,C77,C78,C8,C83,C85,C87,D1,D10,D11,D2,D3,D4,D6,D7,D9 |
Chr6:30756459 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | A8 |
Chr6:30756506 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 5 | B139,B14,B19,B32,C4 |
Chr6:30756565 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | A24 |
Chr6:30756570 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | stop_gained | 35 | A2,A20,A23,B108,B118,B15,B2,B22,B24,B26,B34,B38,B39,B44,B5,B52,B57,B62,B67,B75,B77,B84,B86,B9,B97,C2,C25,C36,C4,C51,C53,C73,C84,C9,D7 |
Chr6:30756591 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | stop_gained | 9 | B107,B39,B66,B70,B72,C53,C69,C84,D7 |
Chr6:30756605 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | A10 |
Chr6:30756606 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | A10 |
Chr6:30756625 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | A10 |
Chr6:30756634 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | B114,B58,C74 |
Chr6:30756636 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | B114,B58,C74 |
Chr6:30756672 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 5 | A13,B119,B123,B130,C28 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。