当前解析结果
SmilChr06G002210| 统一新 Gene ID | SmilChr06G002210 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr06G002210 |
| 描述 | uncharacterized SmilChr06G002210 |
| 染色体 / SeqID | Chr06 / NC_080392.1 |
| 坐标与链方向 | 30856935 - 30857470 / + |
| NCBI Gene ID | LOC130990755 |
|---|---|
| GeneID | 130990755 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC130990755 |
| 原始查询 | LOC130990755 |
| 来源 | GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | hit=Os03g0627900; species=rice; confidence=low |
| 产物 | hit=Os03g0627900; species=rice; confidence=low |
| Arabidopsis | -- |
| Rice | Os03g0627900- identity=33; qcov=1.31; evalue=1.27e-24; confidence=low |
| GO | - |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:130990755 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Nucleus | 细胞核 | 1.00000 | XP_057770966.1 |
| 2 | Cytoplasm | 细胞质 | 0.60000 | XP_057770966.1 |
| 3 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057770966.1 |
| 4 | Centromere | 着丝粒 | 0.00000 | XP_057770966.1 |
| 5 | Chromatin | 染色质 | 0.00000 | XP_057770966.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr6:30856938 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 5 | A13,B23,C17,D4,D7 |
Chr6:30856942 |
CT |
C |
1bp_deletion | frameshift_variant | 1 | B3 |
Chr6:30856942 |
CT |
C |
1bp_deletion | CDS_variant | 1 | B3 |
Chr6:30856949 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 5 | A13,B1,B23,D4,D7 |
Chr6:30856985 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B86 |
Chr6:30856986 |
TG |
T |
1bp_deletion | frameshift_variant | 6 | B114,B25,B35,B64,B88,C24 |
Chr6:30857066 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B86,C21 |
Chr6:30857078 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 5 | B35,C1,C17,C21,C72 |
Chr6:30857096 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | A14 |
Chr6:30857104 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | A7,B104,C21,C72 |
Chr6:30857107 |
AC |
A |
1bp_deletion | frameshift_variant | 11 | A14,A23,B115,B2,B4,B46,B91,C15,C54,C77,C80 |
Chr6:30857111 |
AT |
A |
1bp_deletion | frameshift_variant | 1 | A14 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。