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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr06G002304`

染色体: Chr06 坐标: 33274980-33281278 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr06G002304`
名称	SmilChr06G002304
描述	vicilin-like seed storage protein At2g18540
染色体 / SeqID	Chr06 / NC_080392.1
坐标与链方向	33274980 - 33281278 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130990778`
GeneID	`130990778`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130990778`
原始查询	`LOC130990778`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	vicilin-like seed storage protein At2g18540
产物	vicilin-like seed storage protein At2g18540
Arabidopsis	`AT2G18540` (AT2G18540) RmlC-like cupins superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:816369] identity=42.5; qcov=0.578; evalue=6.23e-105; confidence=medium
Rice	`Os03g0197300` - identity=39.5; qcov=0.599; evalue=9.62e-90; confidence=medium
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF00190 (Cupin_1)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130990778

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Endoplasmic reticulum	内质网	0.40000	`XP_057770993.1`
2	Cytosol	细胞质基质	0.20000	`XP_057770993.1`
3	Secreted	分泌到胞外	0.20000	`XP_057770993.1`
4	Vacuole	液泡	0.20000	`XP_057770993.1`
5	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057770993.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr6:33275409`	`C`	`CTT`	2bp_insertion	frameshift_variant	31	A10,A15,A9,B10,B101,B124,B134,B137,B33,B39,B46,B52,B61,B64,B65,B69,B72,B78,B91,B93,C14,C16,C24,C36,C40,C43,C48,C5,C53,C55,C64
`Chr6:33275410`	`C`	`CA`	1bp_insertion	frameshift_variant	30	A10,A15,A9,B10,B101,B124,B134,B137,B33,B39,B46,B52,B61,B64,B65,B69,B72,B78,B91,B93,C14,C16,C24,C36,C40,C43,C48,C5,C55,C64
`Chr6:33275697`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	C14,C17,C36,C68
`Chr6:33275714`	`T`	`TCC`	2bp_insertion	frameshift_variant	1	C49
`Chr6:33275714`	`T`	`TCC`	2bp_insertion	CDS_variant	1	C49
`Chr6:33275724`	`T`	`TC`	1bp_insertion	frameshift_variant	1	C49
`Chr6:33275724`	`T`	`TC`	1bp_insertion	CDS_variant	1	C49
`Chr6:33276000`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D1
`Chr6:33276258`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B65,C49
`Chr6:33276313`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D4
`Chr6:33276333`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B24
`Chr6:33280674`	`GA`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	162	A10,A13,A14,A15,A18,A2,A22,A23,A24,A25,A4,A5,A6,A7,A9,B1,B10,B100,B101,B104,B105,B106,B107,B11,B110,B112,B114,B115,B117,B118,B12,B121,B122,B123,B124,B125,B126,B129,B130,B134,B135,B136,B137,B138,B140,B16,B17,B19,B2,B21,B23,B24,B26,B27,B29,B33,B36,B37,B38,B39,B42,B44,B46,B49,B5,B50,B52,B54,B55,B56,B60,B61,B62,B63,B64,B65,B66,B67,B69,B70,B71,B72,B73,B74,B78,B84,B87,B88,B90,B91,B92,B93,B95,B96,B97,B98,C11,C12,C13,C14,C15,C16,C17,C18,C2,C20,C22,C23,C24,C25,C26,C30,C32,C33,C35,C36,C37,C38,C4,C43,C44,C45,C46,C47,C48,C49,C5,C51,C53,C54,C55,C56,C57,C58,C59,C6,C61,C62,C63,C64,C66,C68,C69,C72,C73,C78,C8,C80,C81,C83,C85,C87,C9,D1,D10,D11,D2,D3,D5,D6,D8,D9

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057770993.1

815 aa

408

815

Cupin_1

PF00190 Cupin_1 353-506 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057770993.1`	Pfam	`PF00190`	Cupin_1	Domain	353	506	3.7e-44	150.7	Cupin

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057915010.1
ATGAAAATCAAGGCTCTATTTATAGTCTTCAATTCAATCTTGATCACCATCAAACTTGCCATACAAAATTGGACTCTAAAGGCAATAGAATCGTGTAAGAGAAGCTCTGCAACATTAGCGAACTCTGGAAAGTCGGCTCTGCAAAGGTATAGTTCAGAGCTAAAAGTTAGCTCTGGGAATAGTGCAGAGCTGAAACTCTGCTCTGCCAAGTTAACTCTGCTCTGCATAGGGAAGTTCAGCACTGGAGACTTCAGCTCTGA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130990778
ATGAAAATCAAGGCTCTATTTATAGTCTTCAATTCAATCTTGATCACCATCAAACTTGCCATACAAAATTGGACTCTAAAGGCAATAGAATCGTGTAAGAGAAGCTCTGCAACATTAGCGAACTCTGGAAAGTCGGCTCTGCAAAGGTATAGTTCAGAGCTAAAAGTTAGCTCTGGGAATAGTGCAGAGCTGAAACTCTGCTCTGCCAAGTTAACTCTGCTCTGCATAGGGAAGTTCAGCACTGGAGACTTCAGCTCTGA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057770993.1
MKIKALFIVFNSILITIKLAIQNWTLKAIESCKRSSATLANSGKSALQRYSSELKVSSGNSAELKLCSAKLTLLCIGKFSTGDFSSDSASQLCSATELSSKLCSSELLCSALQRDFRLWHGLFSSAWAFSALHGRACNGGEEGEGFVVRRGERRVLVSTENGEIVGARVGTSYLLHFFTMEPNSLFLPVILHSDMFFYVHTGSGKLLWTEENELKTADLRRGDVYRLKAGAAFFIQSNLETETQRQKLRIHSIFPNTNTD...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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