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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr06G002334`

染色体: Chr06 坐标: 33871038-33875530 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr06G002334`
名称	SmilChr06G002334
描述	uncharacterized SmilChr06G002334
染色体 / SeqID	Chr06 / NC_080392.1
坐标与链方向	33871038 - 33875530 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130990791`
GeneID	`130990791`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130990791`
原始查询	`LOC130990791`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os03g0643050; species=rice; confidence=medium
产物	hit=Os03g0643050; species=rice; confidence=medium
Arabidopsis	`AT5G41980` (AT5G41980) nuclease [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:834203] identity=31.1; qcov=0.792; evalue=1.18e-34; confidence=low
Rice	`Os03g0643050` - identity=37.6; qcov=0.686; evalue=1.47e-50; confidence=medium
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF13359 (DDE_Tnp_4)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130990791

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057771007.1`
2	Chromosome	染色体	0.60000	`XP_057771007.1`
3	Telomere	端粒	0.60000	`XP_057771007.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057771007.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057771007.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr6:33871049`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	5	B47,B85,C33,C85,D1
`Chr6:33871049`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B47,B85,C33,C85,D1
`Chr6:33871051`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	167	A1,A11,A14,A16,A18,A2,A20,A21,A23,A24,A25,A3,A5,A6,A7,A8,A9,B101,B106,B107,B108,B109,B11,B110,B112,B115,B117,B118,B119,B12,B121,B123,B124,B125,B128,B129,B13,B130,B131,B132,B133,B136,B138,B15,B16,B18,B19,B2,B20,B21,B24,B26,B27,B28,B3,B31,B32,B4,B42,B43,B44,B45,B46,B47,B48,B49,B5,B50,B52,B53,B54,B55,B57,B58,B6,B62,B63,B64,B65,B66,B68,B69,B7,B70,B71,B72,B73,B74,B75,B76,B77,B78,B79,B8,B80,B81,B82,B84,B90,B92,B93,B94,B97,C1,C10,C11,C12,C14,C16,C18,C19,C20,C21,C22,C23,C25,C27,C3,C31,C33,C34,C35,C36,C37,C38,C4,C41,C42,C43,C47,C49,C51,C53,C54,C55,C56,C59,C6,C60,C61,C62,C63,C67,C69,C7,C70,C71,C72,C73,C76,C77,C78,C79,C8,C80,C83,C84,C85,C86,C9,D10,D2,D3,D4,D5,D8,D9
`Chr6:33871058`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B57,C55
`Chr6:33871081`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	41	A11,A18,A22,A9,B106,B110,B111,B124,B131,B134,B138,B23,B37,B42,B45,B49,B55,B56,B6,B64,B65,B68,B91,B96,C19,C26,C30,C36,C38,C43,C48,C51,C57,C59,C63,C64,C72,C76,C81,D10,D11
`Chr6:33871112`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B63,B83,C46
`Chr6:33871119`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	236	A1,A10,A11,A13,A14,A15,A16,A18,A19,A2,A20,A21,A22,A23,A24,A25,A3,A4,A5,A6,A7,A8,A9,B1,B100,B101,B102,B103,B104,B106,B107,B108,B109,B11,B110,B112,B113,B114,B115,B117,B118,B119,B12,B121,B122,B123,B124,B125,B126,B128,B129,B13,B130,B131,B132,B133,B134,B135,B136,B137,B138,B139,B14,B140,B15,B16,B17,B18,B19,B2,B20,B21,B22,B23,B24,B25,B26,B27,B28,B29,B3,B30,B31,B32,B33,B34,B36,B39,B4,B40,B41,B42,B44,B45,B46,B47,B48,B49,B5,B50,B51,B52,B53,B54,B55,B56,B57,B58,B59,B6,B60,B61,B62,B63,B64,B65,B68,B69,B7,B70,B71,B72,B73,B74,B75,B76,B77,B78,B79,B8,B80,B81,B82,B84,B85,B86,B87,B88,B89,B90,B91,B92,B93,B94,B96,B97,B98,C1,C10,C11,C12,C13,C14,C15,C16,C17,C19,C20,C21,C22,C23,C25,C26,C27,C28,C3,C30,C31,C32,C33,C34,C35,C36,C37,C38,C39,C4,C41,C42,C43,C44,C45,C47,C48,C49,C5,C50,C51,C52,C53,C54,C55,C56,C57,C59,C6,C60,C61,C62,C63,C64,C66,C67,C68,C69,C7,C70,C71,C72,C73,C75,C76,C77,C78,C79,C8,C80,C81,C82,C83,C84,C85,C86,C87,C9,D1,D10,D11,D2,D3,D4,D5,D6,D7,D8,D9
`Chr6:33871121`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B63,B83,C46
`Chr6:33871132`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	6	A6,B133,B31,B53,B64,C6
`Chr6:33871133`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	1	C52
`Chr6:33871133`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C52
`Chr6:33871155`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B114,B27,B57

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057771007.1

341 aa

170

341

DDE_Tnp_4

PF13359 DDE_Tnp_4 115-280 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057771007.1`	Pfam	`PF13359`	DDE_Tnp_4	Domain	115	280	2.2e-19	70.3	DDE superfamily endonuclease

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057915024.1
ATGAACGAATGGTGGGAGAAGCTGAAAGAATGTTACACCAAGTGGGTTATCTTTGCCAATCTTAACATGAATTCGGATTTCCAGAAAGAAGCCTGGAAGTATTTTCTTGTTAACTGGCATGAAAGAGGAATGGTTGAAAGAATGCAGACTGCTCAAAGAGAAGCGAAACTTTTGATTCCTAATCCCTTGAAGATGACGGTTTACTCTCCGACAATTAGAAATGGCGTCAATAGAGAATCTATTAAGAGAGAAGTCAGAGC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130990791
ATGAACGAATGGTGGGAGAAGCTGAAAGAATGTTACACCAAGTGGGTTATCTTTGCCAATCTTAACATGAATTCGGATTTCCAGAAAGAAGCCTGGAAGTATTTTCTTGTTAACTGGCATGAAAGAGGAATGGTTGAAAGAATGCAGACTGCTCAAAGAGAAGCGAAACTTTTGATTCCTAATCCCTTGAAGATGACGGTTTACTCTCCGACAATTAGAAATGGCGTCAATAGAGAATCTATTAAGAGAGAAGTCAGAGC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057771007.1
MNEWWEKLKECYTKWVIFANLNMNSDFQKEAWKYFLVNWHERGMVERMQTAQREAKLLIPNPLKMTVYSPTIRNGVNRESIKREVRAICKIWNVPSNSSSDDLDKIRKTGCLGALDGTYINLMVSNIDKPRYQTRKAQISTNTLAVCDRNKKFVYVLPGWEGSTTDSRILRDALQRANGLRVPKVSNACNYYLCNNGYANSKGFLAPYKRIRYHLKKWRPNATRPQNAMELFNLRHSKACNVIERAFRIMKMRWGILRSS...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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