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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr06G002345`

染色体: Chr06 坐标: 34143850-34144551 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr06G002345`
名称	SmilChr06G002345
描述	uncharacterized SmilChr06G002345
染色体 / SeqID	Chr06 / NC_080392.1
坐标与链方向	34143850 - 34144551 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130990796`
GeneID	`130990796`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130990796`
原始查询	`LOC130990796`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os04g0629600; species=rice; confidence=weak
产物	hit=Os04g0629600; species=rice; confidence=weak
Arabidopsis	`-` -
Rice	`Os04g0629600` - identity=24.3; qcov=0.867; evalue=2.73e-11; confidence=weak
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF14223 (Retrotran_gag_2)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130990796

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057771012.1`
2	Cytosol	细胞质基质	0.40000	`XP_057771012.1`
3	Nucleus	细胞核	0.20000	`XP_057771012.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057771012.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057771012.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr6:34143861`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C47
`Chr6:34143931`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B122,B140,B37,B71,B72
`Chr6:34143949`	`G`	`GA`	1bp_insertion	frameshift_variant	15	A19,B10,B110,B113,B121,B13,B14,B23,B42,B43,B60,B86,C74,D3,D6
`Chr6:34144070`	`AGT`	`A`	2bp_deletion	frameshift_variant	2	B65,C49
`Chr6:34144070`	`AGT`	`A`	2bp_deletion	CDS_variant	2	B65,C49
`Chr6:34144105`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	21	A1,B100,B130,B135,B54,B56,B63,B71,B83,B96,C19,C21,C23,C29,C32,C54,C59,C63,C68,C77,D3
`Chr6:34144169`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A19
`Chr6:34144171`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B68
`Chr6:34144177`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	1	B16
`Chr6:34144177`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B16
`Chr6:34144240`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B45
`Chr6:34144266`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B124,C18

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057771012.1

233 aa

116

233

Retrotran_gag_2

PF14223 Retrotran_gag_2 98-201 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057771012.1`	Pfam	`PF14223`	Retrotran_gag_2	Domain	98	201	7.1e-13	49.4	gag-polypeptide of LTR copia-type

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057915029.1
ATGTCGAATTTGTCGCTAAAGTGTTTGATGGAAACTGACAAGTTGACTGGGTCAAACTTCACGGATTGGCTCCGTTGCTTGCGTCTGGTCTTAAGACTAGAAAAGATTGAGTACGTCTTGGACGACCCAATCTCTGTGATTCTCGACAAGAAATCTGCGGAGTATGCTTCGTTTGACGAAGATGCTCACAAGAAGCATGTCGAGGATGCAACTATGGCTCAGTGTGTAATGTTGACTTTTATGAATACGGAGTTACAGAG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130990796
ATGTCGAATTTGTCGCTAAAGTGTTTGATGGAAACTGACAAGTTGACTGGGTCAAACTTCACGGATTGGCTCCGTTGCTTGCGTCTGGTCTTAAGACTAGAAAAGATTGAGTACGTCTTGGACGACCCAATCTCTGTGATTCTCGACAAGAAATCTGCGGAGTATGCTTCGTTTGACGAAGATGCTCACAAGAAGCATGTCGAGGATGCAACTATGGCTCAGTGTGTAATGTTGACTTTTATGAATACGGAGTTACAGAG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057771012.1
MSNLSLKCLMETDKLTGSNFTDWLRCLRLVLRLEKIEYVLDDPISVILDKKSAEYASFDEDAHKKHVEDATMAQCVMLTFMNTELQRQHEHMFPFEMLKLLKSLYASEAQTMEYEILRDLFKCKLHEGSSVSDHVLKMIGLIERLTSIGTILPATVSVNLILQSLSASFESFIVNFNMNGTKATLAELHNMLKTYESTTSKGKSVLMVSSTATSSKKNKQKKAIDANLKPKGG

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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