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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr06G002395`

染色体: Chr06 坐标: 34738456-34738914 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr06G002395`
名称	SmilChr06G002395
描述	uncharacterized SmilChr06G002395
染色体 / SeqID	Chr06 / NC_080392.1
坐标与链方向	34738456 - 34738914 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130990807`
GeneID	`130990807`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130990807`
原始查询	`LOC130990807`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	AT2G17070; symbol=AT2G17070; hit=AT2G17070; species=arabidopsis; confidence=low
产物	AT2G17070; symbol=AT2G17070; hit=AT2G17070; species=arabidopsis; confidence=low
Arabidopsis	`AT2G17070` (AT2G17070) - identity=36.1; qcov=0.875; evalue=4.74e-17; confidence=low
Rice	`Os08g0553500` - identity=30.4; qcov=0.822; evalue=6.99e-09; confidence=low
GO	GO:0048364 (root development); GO:0048367 (shoot system development)
KEGG	-
Pfam	PF03087 (BPS1)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130990807

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057771025.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.80000	`XP_057771025.1`
3	Cytosol	细胞质基质	0.40000	`XP_057771025.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057771025.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057771025.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr6:34738674`	`C`	`CTA`	2bp_insertion	stop_gained,frameshift_variant	57	A1,A11,A19,A24,A3,A9,B102,B105,B12,B13,B134,B137,B16,B20,B23,B31,B35,B44,B46,B53,B54,B55,B58,B61,B66,B76,B77,B78,B84,B9,B90,B92,B93,B94,C17,C18,C2,C21,C27,C29,C32,C33,C37,C38,C42,C48,C5,C53,C58,C61,C63,C64,C79,C80,C83,D11,D3
`Chr6:34738690`	`C`	`CAA`	2bp_insertion	frameshift_variant	8	A1,A9,B12,B137,B54,B55,B71,C2
`Chr6:34738704`	`G`	`GT`	1bp_insertion	frameshift_variant	40	A20,A21,B1,B100,B106,B111,B119,B129,B140,B15,B2,B22,B24,B3,B30,B34,B47,B48,B7,B70,B82,B97,C13,C15,C2,C21,C22,C25,C29,C32,C60,C61,C62,C68,C82,C87,C9,D4,D5,D7
`Chr6:34738735`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	38	A20,A21,B1,B100,B106,B119,B129,B140,B15,B2,B22,B24,B3,B30,B34,B47,B48,B7,B70,B82,B97,C13,C15,C2,C21,C22,C25,C29,C32,C60,C61,C62,C68,C82,C87,C9,D5,D7
`Chr6:34738738`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C62
`Chr6:34738762`	`AG`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	A1
`Chr6:34738762`	`AG`	`A`	1bp_deletion	CDS_variant	1	A1
`Chr6:34738763`	`G`	`GA`	1bp_insertion	frameshift_variant	45	A10,A15,A18,A7,B10,B103,B113,B132,B15,B2,B25,B26,B27,B38,B39,B42,B43,B44,B47,B51,B52,B57,B61,B72,B77,B78,B8,B92,C16,C3,C4,C46,C47,C49,C50,C52,C55,C58,C6,C7,C73,C78,C8,C82,D9
`Chr6:34738825`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C62
`Chr6:34738826`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C82
`Chr6:34738841`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B66,B98
`Chr6:34738859`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C82

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057771025.1

152 aa

152

BPS1

PF03087 BPS1 29-146 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057771025.1`	Pfam	`PF03087`	BPS1	Family	29	146	2.2e-27	97.1	Protein BPS1

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057915042.1
ATGCATGAATTCTCAGCCAAAGAGAATATAAAGAAAATATCATTTTGTAGATCTTCGGAGGCTGCTTGCTCCTCCCTCTCATCAATCAATGGCCTCAGAAATTTATACGAGAGCATTGATGATTTGCTTCTCTTGCCTCACATTCAACAGATTGTTTCTGAGGAATGTGTTGATGGTTACATCAACCTATTGGATTCTTGCAGCTCAGTTAAGGATCTCATCTCACTTTCCAAGCAAAATTTAAGAGAGATTTTGTCTGC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130990807
ATGCATGAATTCTCAGCCAAAGAGAATATAAAGAAAATATCATTTTGTAGATCTTCGGAGGCTGCTTGCTCCTCCCTCTCATCAATCAATGGCCTCAGAAATTTATACGAGAGCATTGATGATTTGCTTCTCTTGCCTCACATTCAACAGATTGTTTCTGAGGAATGTGTTGATGGTTACATCAACCTATTGGATTCTTGCAGCTCAGTTAAGGATCTCATCTCACTTTCCAAGCAAAATTTAAGAGAGATTTTGTCTGC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057771025.1
MHEFSAKENIKKISFCRSSEAACSSLSSINGLRNLYESIDDLLLLPHIQQIVSEECVDGYINLLDSCSSVKDLISLSKQNLREILSALRRKDVRGINGYLASRKRLKKMIQKCLKNMRRSSASASSENASMLTDAESVAISLLESLGRWCQS

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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