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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr06G002403`

染色体: Chr06 坐标: 34804983-34813230 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr06G002403`
名称	SmilChr06G002403
描述	uncharacterized SmilChr06G002403
染色体 / SeqID	Chr06 / NC_080392.1
坐标与链方向	34804983 - 34813230 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130990813`
GeneID	`130990813`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130990813`
原始查询	`LOC130990813`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os06g0597250; species=rice; confidence=medium
产物	hit=Os06g0597250; species=rice; confidence=medium
Arabidopsis	`AT2G13770` (AT2G13770) nuclease [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:815861] identity=40.3; qcov=0.69; evalue=5.87e-28; confidence=medium
Rice	`Os06g0597250` - identity=42.2; qcov=0.889; evalue=2.12e-48; confidence=medium
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF28509 (DUF8418)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130990813

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057771032.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057771032.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057771032.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057771032.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057771032.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr6:34812615`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B52
`Chr6:34812622`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B7,B94,C15,C22
`Chr6:34812625`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B12,C86
`Chr6:34812663`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B74
`Chr6:34812694`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	2	B12,C86
`Chr6:34812694`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B12,C86
`Chr6:34812735`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	14	B120,B125,B25,B38,B39,B44,B51,B52,C4,C46,C59,C66,C76,C8
`Chr6:34812737`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B32
`Chr6:34812754`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C65
`Chr6:34812771`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C46
`Chr6:34812792`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A13
`Chr6:34812798`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B23,B65,C49,C65,D3

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057771032.1

216 aa

108

216

DUF8418

PF28509 DUF8418 68-106 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057771032.1`	Pfam	`PF28509`	DUF8418	Domain	68	106	5.2e-18	65.2	Domain of unknown function (DUF8418)

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057915049.1
ATGTCTTCATCATCTTCTGAGCATGATGCTGAAGACACAGCTACAACTGCAGCTAAAGCTGTAGCTGAAGCTGAAGCCTTTATGGAAGAGTACATGCGCCAATACATGAAGGATGACAGTATTCATCAACGTGTACTTCGAGCAATAGCGTCAAACACAAGTCACACGAGAAGATATGTGCAACGAGACCGAGAAGGAGCACACGAGCGACTCATGCAGGATTATTTTGATGATAATCCAACATGGGGTCCCAATGTATT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130990813
ATGTCTTCATCATCTTCTGAGCATGATGCTGAAGACACAGCTACAACTGCAGCTAAAGCTGTAGCTGAAGCTGAAGCCTTTATGGAAGAGTACATGCGCCAATACATGAAGGATGACAGTATTCATCAACGTGTACTTCGAGCAATAGCGTCAAACACAAGTCACACGAGAAGATATGTGCAACGAGACCGAGAAGGAGCACACGAGCGACTCATGCAGGATTATTTTGATGATAATCCAACATGGGGTCCCAATGTATT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057771032.1
MSSSSSEHDAEDTATTAAKAVAEAEAFMEEYMRQYMKDDSIHQRVLRAIASNTSHTRRYVQRDREGAHERLMQDYFDDNPTWGPNVFRWRFRIRKELFTRIVNALEAYNIWFQQRPDATGKKGFTPLQKCTNAIRQLAYGGPADHYDEYLRVSETTGYECLRYFCRGVIEVFGAHYLKWPTFHDYQCLMEMHKQKHDFPEMLGSLDWSNNDINVLN

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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