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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr06G002407`

染色体: Chr06 坐标: 34822848-34823414 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr06G002407`
名称	SmilChr06G002407
描述	uncharacterized SmilChr06G002407
染色体 / SeqID	Chr06 / NC_080392.1
坐标与链方向	34822848 - 34823414 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130990815`
GeneID	`130990815`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130990815`
原始查询	`LOC130990815`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	AT2G17070; symbol=AT2G17070; hit=AT2G17070; species=arabidopsis; confidence=medium
产物	AT2G17070; symbol=AT2G17070; hit=AT2G17070; species=arabidopsis; confidence=medium
Arabidopsis	`AT2G17070` (AT2G17070) - identity=39.3; qcov=0.947; evalue=1.4e-22; confidence=medium
Rice	`Os11g0160000` - identity=29.5; qcov=0.92; evalue=7.02e-11; confidence=low
GO	GO:0048364 (root development); GO:0048367 (shoot system development)
KEGG	-
Pfam	PF03087 (BPS1)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130990815

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057771034.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.80000	`XP_057771034.1`
3	Cytosol	细胞质基质	0.60000	`XP_057771034.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057771034.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057771034.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr6:34822930`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A22,C86
`Chr6:34822934`	`CTG`	`C`	2bp_deletion	frameshift_variant	145	A1,A13,A14,A15,A2,A22,A23,A24,A25,A3,A4,A5,A8,A9,B1,B101,B105,B108,B11,B110,B111,B113,B115,B117,B12,B120,B121,B122,B123,B124,B126,B127,B128,B129,B130,B131,B132,B133,B134,B136,B137,B138,B15,B17,B18,B19,B21,B22,B24,B26,B28,B29,B3,B30,B31,B34,B36,B4,B42,B43,B45,B49,B5,B50,B53,B54,B55,B58,B59,B6,B60,B61,B62,B64,B65,B67,B68,B69,B71,B72,B75,B79,B8,B80,B81,B85,B86,B87,B88,B89,B9,B95,B98,C1,C10,C11,C12,C14,C16,C17,C2,C20,C23,C24,C25,C26,C28,C3,C30,C34,C35,C36,C38,C39,C40,C41,C43,C45,C47,C50,C52,C53,C54,C56,C57,C6,C60,C67,C69,C7,C70,C72,C73,C76,C78,C79,C83,C84,C85,D1,D2,D5,D6,D8,D9
`Chr6:34823043`	`GT`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	8	B117,B25,C27,C31,C56,C65,C70,C77
`Chr6:34823045`	`AG`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	8	B117,B25,C27,C31,C56,C65,C70,C77
`Chr6:34823106`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B66,B98
`Chr6:34823178`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B108
`Chr6:34823333`	`T`	`TA`	1bp_insertion	frameshift_variant	3	A10,B12,C86
`Chr6:34823333`	`T`	`TA`	1bp_insertion	CDS_variant	3	A10,B12,C86
`Chr6:34823378`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B52,D4

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057771034.1

188 aa

188

BPS1

PF03087 BPS1 55-181 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057771034.1`	Pfam	`PF03087`	BPS1	Family	55	181	3.4e-27	96.5	Protein BPS1

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057915051.1
ATGGCTCCCTCACCTTTGAGATCCAAGTCACTTAACCATGGCCGCTCTCTTAGCTTCCCATCTTCATCACATCCTGCTCCTACTCACTTCGATGAGAACTTATCCAGATTGAGATCTTCCGAGGCTGCTTGCTCGTCGCTCTCATCCATCAACCGCGCTGCAAATGGCCTCAGAAACTTATATGAGAGCATCGATGATTTGCTTCTCTTGCCTCACATTCAGCAGATCGTTTCTGAGGAGTGTGTTGATAATTACATCAG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130990815
ATGGCTCCCTCACCTTTGAGATCCAAGTCACTTAACCATGGCCGCTCTCTTAGCTTCCCATCTTCATCACATCCTGCTCCTACTCACTTCGATGAGAACTTATCCAGATTGAGATCTTCCGAGGCTGCTTGCTCGTCGCTCTCATCCATCAACCGCGCTGCAAATGGCCTCAGAAACTTATATGAGAGCATCGATGATTTGCTTCTCTTGCCTCACATTCAGCAGATCGTTTCTGAGGAGTGTGTTGATAATTACATCAG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057771034.1
MAPSPLRSKSLNHGRSLSFPSSSHPAPTHFDENLSRLRSSEAACSSLSSINRAANGLRNLYESIDDLLLLPHIQQIVSEECVDNYISLLDASSSVKDLISLVKEDLRELLSAVRRKDVRGINGYLALRKQSKKKIQKCLKKLRRSSASAFSENVSMLKDAESVAISLLESLLSYTLGMTMQESIRRRE

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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