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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr06G002427`

染色体: Chr06 坐标: 35031614-35033056 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr06G002427`
名称	SmilChr06G002427
描述	uncharacterized SmilChr06G002427
染色体 / SeqID	Chr06 / NC_080392.1
坐标与链方向	35031614 - 35033056 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130990820`
GeneID	`130990820`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130990820`
原始查询	`LOC130990820`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os08g0106900; species=rice; confidence=low
产物	hit=Os08g0106900; species=rice; confidence=low
Arabidopsis	`AT5G41980` (AT5G41980) nuclease [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:834203] identity=29.9; qcov=1; evalue=1.39e-37; confidence=low
Rice	`Os08g0106900` - identity=31.9; qcov=1.22; evalue=8.54e-52; confidence=low
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF01609 (DDE_Tnp_1); PF04827 (Plant_tran); PF13359 (DDE_Tnp_4)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130990820

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057771038.1`
2	Telomere	端粒	0.20000	`XP_057771038.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057771038.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057771038.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057771038.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr6:35031807`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B13,C45,C52
`Chr6:35032096`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B26,B78,B90
`Chr6:35032289`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C15
`Chr6:35032446`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C35
`Chr6:35032449`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C35
`Chr6:35032452`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B98,C48
`Chr6:35032482`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C35
`Chr6:35032613`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C48
`Chr6:35032654`	`TA`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	70	A18,A2,A21,A5,A7,A8,B104,B105,B107,B117,B12,B123,B128,B129,B132,B136,B138,B140,B15,B20,B33,B36,B4,B41,B44,B48,B55,B57,B66,B71,B75,B76,B80,B85,B87,B90,B92,B94,B95,B99,C1,C10,C15,C17,C18,C24,C3,C31,C32,C33,C34,C35,C38,C40,C41,C43,C49,C55,C59,C60,C61,C71,C73,C82,C83,C87,D10,D2,D5,D9
`Chr6:35032675`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B82,C17,C26,C51
`Chr6:35032689`	`C`	`CGG`	2bp_insertion	frameshift_variant	67	A18,A19,A2,A21,A24,A5,A7,A8,B104,B105,B107,B12,B123,B128,B129,B132,B136,B138,B15,B20,B34,B4,B41,B55,B57,B61,B66,B69,B71,B75,B76,B80,B90,B92,B94,B95,B99,C1,C10,C17,C24,C3,C31,C32,C34,C35,C38,C39,C40,C43,C49,C53,C55,C60,C61,C69,C71,C73,C77,C8,C82,C83,C87,D10,D3,D5,D9
`Chr6:35032691`	`AAT`	`A`	2bp_deletion	frameshift_variant	64	A18,A19,A2,A24,A7,A8,B104,B105,B107,B12,B123,B128,B129,B132,B136,B138,B15,B20,B34,B4,B41,B55,B57,B61,B66,B69,B71,B75,B76,B80,B90,B92,B94,B95,B99,C1,C10,C17,C24,C3,C31,C32,C35,C38,C39,C40,C43,C49,C53,C55,C60,C61,C69,C71,C73,C77,C8,C82,C83,C87,D10,D3,D5,D9

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057771038.1

338 aa

169

338

DDE_Tnp_4

DDE_Tnp_1

Plant_tran

PF13359 DDE_Tnp_4 160-277 aa PF01609 DDE_Tnp_1 163-275 aa PF04827 Plant_tran 221-279 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057771038.1`	Pfam	`PF13359`	DDE_Tnp_4	Domain	160	277	3.8e-15	56.6	DDE superfamily endonuclease
`XP_057771038.1`	Pfam	`PF01609`	DDE_Tnp_1	Domain	163	275	1.7e-06	28.6	Transposase DDE domain
`XP_057771038.1`	Pfam	`PF04827`	Plant_tran	Family	221	279	7.3e-06	26.5	Plant transposon protein

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057915055.1
ATGCCGATTGATGATGATACCACTGTGTGCATATATCTTCTGATGGAAGAGCTTTTGCTGCAAAACATAATTCTAATACTGGTAACATATCACATTATGGCTAGATTGAGATCACGTAAACGAAAGAGAACTAATAATGTTGCATCTTTTGGAATGATTGAACGTATTCCCGATCAAGTTATGCATATGAGTAGACTCGTAGGTGTTAGCGATATTGATTGCCTAGCAAATCTACGAATGGACCGCAATACATTCGGTAG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130990820
ATGCCGATTGATGATGATACCACTGTGTGCATATATCTTCTGATGGAAGAGCTTTTGCTGCAAAACATAATTCTAATACTGGTAACATATCACATTATGGCTAGATTGAGATCACGTAAACGAAAGAGAACTAATAATGTTGCATCTTTTGGAATGATTGAACGTATTCCCGATCAAGTTATGCATATGAGTAGACTCGTAGGTGTTAGCGATATTGATTGCCTAGCAAATCTACGAATGGACCGCAATACATTCGGTAG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057771038.1
MPIDDDTTVCIYLLMEELLLQNIILILVTYHIMARLRSRKRKRTNNVASFGMIERIPDQVMHMSRLVGVSDIDCLANLRMDRNTFGRLCIVLRDLGGLTDGRYIKVEEQAILKLHTILLVKPVPVPDDCTDNRWRWFKGCLGALDGTYINVMVSNADKPSWEGSAVDSRILRDALTRVNGLRVPKGNYYLCDNGYANSEGFLAPYKGIRYHLKEWGPNAARPQNQMELFNLRHSKARNVIERAFGVLKMRWGILRSNSFY...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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