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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr06G002439`

染色体: Chr06 坐标: 35143045-35143452 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr06G002439`
名称	SmilChr06G002439
描述	uncharacterized SmilChr06G002439
染色体 / SeqID	Chr06 / NC_080392.1
坐标与链方向	35143045 - 35143452 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130990821`
GeneID	`130990821`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130990821`
原始查询	`LOC130990821`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	confidence=no_hit
产物	confidence=no_hit
Arabidopsis	`-` -
Rice	`-` -
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF14392 (zf-CCHC_4)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130990821

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057771039.1`
2	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057771039.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057771039.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057771039.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057771039.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr6:35143070`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A18,B62
`Chr6:35143116`	`G`	`GC`	1bp_insertion	frameshift_variant	2	A18,B62
`Chr6:35143116`	`G`	`GC`	1bp_insertion	CDS_variant	2	A18,B62
`Chr6:35143140`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A18,B62
`Chr6:35143150`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B23,B58,C5,C80
`Chr6:35143233`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B127,B139,B17,B82,C20
`Chr6:35143286`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B65,B76,C18,C48,C49
`Chr6:35143291`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B127,B139,B17,B82,C20
`Chr6:35143301`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B62
`Chr6:35143352`	`AG`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	3	B10,B101,B140
`Chr6:35143352`	`AG`	`A`	1bp_deletion	CDS_variant	3	B10,B101,B140
`Chr6:35143361`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	26	A1,A2,B109,B118,B122,B133,B136,B35,B56,B63,B68,B73,B83,B85,B94,B96,B99,C12,C22,C30,C33,C37,C40,C74,C75,C85

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057771039.1

135 aa

135

zf-CCHC_4

PF14392 zf-CCHC_4 15-60 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057771039.1`	Pfam	`PF14392`	zf-CCHC_4	Domain	15	60	5.6e-08	33.0	Zinc knuckle

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057915056.1
ATGGGCGTTGTGGGGCATTTCGCAAGAGTTCTCATCGAGATGGACGTGACAAAAGATATCGTCTATAACTTGATTGTTAATAAAGGTTCCTCATTGTTTGAAATCGAGTTTGTTTATGAGAACTTACCGTATTTCTGTGGCATCTGCATGAAAGTGGGACACTCCTCTGATAAATGTCGGCAAAAGATCGATGATTCTAAGAAGGATAATCTGATTCAAAAGAATGATGCGACCTTAAATGCTGAACTCAAAATCTCTAT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130990821
ATGGGCGTTGTGGGGCATTTCGCAAGAGTTCTCATCGAGATGGACGTGACAAAAGATATCGTCTATAACTTGATTGTTAATAAAGGTTCCTCATTGTTTGAAATCGAGTTTGTTTATGAGAACTTACCGTATTTCTGTGGCATCTGCATGAAAGTGGGACACTCCTCTGATAAATGTCGGCAAAAGATCGATGATTCTAAGAAGGATAATCTGATTCAAAAGAATGATGCGACCTTAAATGCTGAACTCAAAATCTCTAT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057771039.1
MGVVGHFARVLIEMDVTKDIVYNLIVNKGSSLFEIEFVYENLPYFCGICMKVGHSSDKCRQKIDDSKKDNLIQKNDATLNAELKISIAGGPKLNRSGNFVKPQTIWKKAENLHTKNSFAALAKIPDENASTKPMK

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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