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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr06G002442`

染色体: Chr06 坐标: 35162435-35162935 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr06G002442`
名称	SmilChr06G002442
描述	protein FAR-RED IMPAIRED RESPONSE 1-like
染色体 / SeqID	Chr06 / NC_080392.1
坐标与链方向	35162435 - 35162935 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130990822`
GeneID	`130990822`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130990822`
原始查询	`LOC130990822`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	protein FAR-RED IMPAIRED RESPONSE 1-like
产物	protein FAR-RED IMPAIRED RESPONSE 1-like
Arabidopsis	`AT4G15090` (FAR1) FRS (FAR1 Related Sequences) transcription factor family [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:827173] identity=26.7; qcov=0.994; evalue=1.29e-17; confidence=low
Rice	`Os01g0852650` - identity=38.3; qcov=0.771; evalue=1.5e-27; confidence=medium
GO	GO:0006355 (regulation of DNA-templated transcription)
KEGG	-
Pfam	PF10551 (MULE)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130990822

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	0.80000	`XP_057771040.1`
2	Cytosol	细胞质基质	0.60000	`XP_057771040.1`
3	Nucleus	细胞核	0.40000	`XP_057771040.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057771040.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057771040.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr6:35162482`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B101,B48,C61
`Chr6:35162511`	`TTG`	`T`	2bp_deletion	frameshift_variant	2	B61,B65
`Chr6:35162511`	`TTG`	`T`	2bp_deletion	CDS_variant	2	B61,B65
`Chr6:35162515`	`G`	`GTT`	2bp_insertion	frameshift_variant	2	B61,B65
`Chr6:35162515`	`G`	`GTT`	2bp_insertion	CDS_variant	2	B61,B65
`Chr6:35162567`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr6:35162635`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B64
`Chr6:35162642`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B24
`Chr6:35162678`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C8
`Chr6:35162692`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B79,B85
`Chr6:35162717`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B79,C18,C7
`Chr6:35162728`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B100,B24

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057771040.1

166 aa

166

MULE

PF10551 MULE 1-40 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057771040.1`	Pfam	`PF10551`	MULE	Domain	1	40	3.9e-09	37.5	MULE transposase domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057915057.1
ATGAATGGAAAGCAACCGGAAGTTATATTCTCCGATCAATGTCAAGCTTTGATGAATGCTATTGATTCTCAATTCAAAGGCGCGGCTCATCGCCTATGTCAATGGCATATCAATCAAAATGCCCCTTCTCACTTTAGGTCCTTGAATGGTAACAGTGAGTTCAAGAGAGCTTGGCATCATTGCATGAATTGGTGCGAGAGCGAGGAAGAATTTGAAAGCTTGTGGACAAAAATGATTGCAGATCATGGATTGGCTGAGCA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130990822
ATGAATGGAAAGCAACCGGAAGTTATATTCTCCGATCAATGTCAAGCTTTGATGAATGCTATTGATTCTCAATTCAAAGGCGCGGCTCATCGCCTATGTCAATGGCATATCAATCAAAATGCCCCTTCTCACTTTAGGTCCTTGAATGGTAACAGTGAGTTCAAGAGAGCTTGGCATCATTGCATGAATTGGTGCGAGAGCGAGGAAGAATTTGAAAGCTTGTGGACAAAAATGATTGCAGATCATGGATTGGCTGAGCA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057771040.1
MNGKQPEVIFSDQCQALMNAIDSQFKGAAHRLCQWHINQNAPSHFRSLNGNSEFKRAWHHCMNWCESEEEFESLWTKMIADHGLAEHRWFASMYRLRQRWASVFTNSRFSAGLHATSRSEVTNRVLKDLSRRSGSLFEFVLNYKTFIGKHPPRKRVKLFQVVHQVN

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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