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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID,以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因,再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。
示例

当前解析结果

SmilChr06G002484

染色体: Chr06 坐标: 35679582-35680058 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene IDSmilChr06G002484
名称SmilChr06G002484
描述uncharacterized SmilChr06G002484
染色体 / SeqIDChr06 / NC_080392.1
坐标与链方向35679582 - 35680058 / -

ID 对照

NCBI Gene IDLOC130990835
GeneID130990835
locus_tag-
NCBI NameLOC130990835
原始查询LOC130990835

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog
描述confidence=no_hit
产物confidence=no_hit
Arabidopsis-
-
Rice-
-
GO-
KEGG-
Pfam-
InterPro-
eggNOG-
NRGeneID:130990835

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank定位位置中文ScoreProtein ID
1 Nucleus 细胞核 0.80000 XP_057771050.1
2 Cytoplasm 细胞质 0.80000 XP_057771050.1
3 Chromosome 染色体 0.00000 XP_057771050.1
4 Centromere 着丝粒 0.00000 XP_057771050.1
5 Chromatin 染色质 0.00000 XP_057771050.1

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置 REF ALT 类型 影响 携带材料数 材料
Chr6:35679589 G A EMS_canonical_SNV CDS_variant 4 A9,B38,C44,C72
Chr6:35679597 G A EMS_canonical_SNV CDS_variant 3 A9,B38,C44
Chr6:35679605 C T EMS_canonical_SNV CDS_variant 4 B26,B37,B45,B87
Chr6:35679635 C T EMS_canonical_SNV CDS_variant 1 C69
Chr6:35679663 C T EMS_canonical_SNV CDS_variant 1 B87
Chr6:35679666 G A EMS_canonical_SNV CDS_variant 2 B38,C28
Chr6:35679671 C T EMS_canonical_SNV CDS_variant 4 B73,C43,C72,C78
Chr6:35679723 G A EMS_canonical_SNV CDS_variant 4 B119,B65,B85,B87
Chr6:35679776 G A EMS_canonical_SNV CDS_variant 4 B17,B74,C43,C72
Chr6:35679780 G A EMS_canonical_SNV CDS_variant 4 B3,B73,B78,C11
Chr6:35679810 C T EMS_canonical_SNV CDS_variant 3 B119,B65,C18
Chr6:35679819 G A EMS_canonical_SNV CDS_variant 2 B34,C85

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

当前发布数据中,此基因没有可展示的 Pfam 结构域命中。

进入结构域查询

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA(仅基因区域)

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA
XM_057915067.1
ATGAGCCCCTACCGCCTTGTCTACGGTAAAGCATGCCACTTACCGGTGGAGGTTGAGCACCGAGCATATTGGGCAATCAAGGCCACAAATTGCGACCTTACAACCGCGGGGAAGCACAGAGCATTGCAAATGGAAGAGCTCGATGAATTACGCAACGAGGCATACGAGAATGCAAGGATCTACAAAGATAAAGTCAAGAGGTTGCATGATAGCCGTATTGTGCCAAAGAATCTCCAACCCGGAATGAAGGTTCTTTTGTT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA
LOC130990835
ATGAGCCCCTACCGCCTTGTCTACGGTAAAGCATGCCACTTACCGGTGGAGGTTGAGCACCGAGCATATTGGGCAATCAAGGCCACAAATTGCGACCTTACAACCGCGGGGAAGCACAGAGCATTGCAAATGGAAGAGCTCGATGAATTACGCAACGAGGCATACGAGAATGCAAGGATCTACAAAGATAAAGTCAAGAGGTTGCATGATAGCCGTATTGTGCCAAAGAATCTCCAACCCGGAATGAAGGTTCTTTTGTT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA
XP_057771050.1
MSPYRLVYGKACHLPVEVEHRAYWAIKATNCDLTTAGKHRALQMEELDELRNEAYENARIYKDKVKRLHDSRIVPKNLQPGMKVLLFNSRLKLFPGKLKSRWSGPFILKEILPHGAVILSKENNEETFTVNGHRVKPYLEHEVVAVVVESQALHDPTF

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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